定量的HIV-1 DNA液滴デジタルPCRアッセイの臨床的検証: HIV-1予防および治癒試験における異なるサブタイプにわたる潜在性HIV-1感染の検出および細胞関連HIV-1動態のモニタリングへの応用【JST・京大機械翻訳】

Powell, L.; Dhummakupt, A.; Siems, L.; Singh, D.; Le Duff, Y.; Uprety, P.; Jennings, C.; Szewczyk, J.; Chen, Y.; Nastouli, E.; Persaud, D.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202206100014442 整理番号：22P0270358

定量的HIV-1 DNA液滴デジタルPCRアッセイの臨床的検証: HIV-1予防および治癒試験における異なるサブタイプにわたる潜在性HIV-1感染の検出および細胞関連HIV-1動態のモニタリングへの応用【JST・京大機械翻訳】

Clinical Validation of a Quantitative HIV-1 DNA Droplet Digital PCR assay: Applications for Detecting Occult HIV-1 Infection and Monitoring Cell-associated HIV-1 Dynamics across Different Subtypes in HIV-1 Prevention and Cure Trials

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発行年： 2020年09月30日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年09月30日
JST資料番号： O7002B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

※このプレプリント論文は学術誌に掲載済みです。なお、学術誌掲載の際には一部内容が変更されている可能性があります。

【背景】HIV-1曝露乳児において,核酸試験(NAT)は,受動的に転送された母性抗体が抗体検査を妨げるので,感染を診断するのに必要である。臨床NATアッセイの感受性は乳児抗レトロウイルス予防により低下し,高リスク乳児の経験的超早期抗レトロウイルス治療により早期乳児診断に影響を与える。同様に,曝露前予防下で獲得された成人HIV-1感染は,低レベル(培養感染)で生じ,検出不能な血漿ウイルス血症および不確定抗体試験があり,HIV-1 DNA試験がおそらく有用な補助剤である。細胞関連HIV-1 DNA濃度も,HIV-1治療,特に周産期感染との関連で,ウイルスリザーバーにおけるHIV-1持続性をモニターするのに使用される。方法:HIV-1 DNA液滴デジタルPCR(ddPCR)アッセイの分析的感度と特異性を,異なるHIV-1サブタイプ(PBMCs)にスパイクしたHIV-1 LTR-gagの160塩基対配列を含むプラスミドの連続希釈を用いて,異なるHIV-1サブタイプ(A,BとC)に感染するMOLT-4細胞またはPBMCsとPBMCsにスパイクしたU1細胞を用いて,異なるHIV-1サブタイプにわたって測定した。日内と日間の変動性を用いて分析精度を測定した。【結果】HIV-1 LTR-gag ddPCR分析は,信頼できて,再現性があり,多重HIV-1サブタイプにわたって,単一コピーレベルに近い感度で,高い分析特異性を示し,4.09コピー/百万PBMCsの検出限界を示した。結論:このアッセイは,乳児と成人の両方で異なるHIV-1サブタイプ,およびHIV-1治療介入,特に周産期感染で,HIV-1予防に使用される併用と長期作用処方の設定で生じる潜在性HIV-1感染を検出するのに応用がある。【JST・京大機械翻訳】

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感染症・寄生虫症一般

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