非コードRNAにより仲介される遠位遺伝子調節は乳癌および前立腺癌に対する生殖系列リスクに寄与する【JST・京大機械翻訳】

Cole, N.; Lee, P.; Schwarz, T.; Zhang, P.; Freedman, M. L.; Gusev, A.; Lindstroem, S.; Gandal, M. J.; Pasaniuc, B.; Bhattacharya, A.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202206158586764 整理番号：22P0320440

非コードRNAにより仲介される遠位遺伝子調節は乳癌および前立腺癌に対する生殖系列リスクに寄与する【JST・京大機械翻訳】

Distal gene regulation mediated by non-coding RNAs contributes to germline risk for breast and prostate cancer

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発行年： 2022年02月23日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年02月23日
JST資料番号： O7002B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

ゲノムワイド関連研究(GWAS)は,乳房および前立腺癌リスクに関連する多数の遺伝子座を同定し,生殖系列遺伝的調節不全が腫瘍形成に影響を及ぼすことを示唆している。しかし,多くの遺伝的関連性の根底にある生物学的機能はよく理解されていない。蛋白質コード遺伝子(pcGenes)に焦点を絞った遺伝子座を注釈する以前の努力は,ヒト細胞におけるほとんどの転写出力を説明する非コードRNA(ncRNA)を大きく無視し,pcGeneと他のncRNAの両方の転写を調節することができる。多くのncRNAの生物学的役割は良く分かっていないが,多くのncRNAは癌発生に関与する。ここでは,非癌および腫瘍乳房および前立腺組織における遺伝子発現調節のトランス作用メディエーターとしてのncRNAsの1つの調節仮説を検討した。原因アンカーとして生殖系列遺伝学を用いて,ncRNA(1メガ塩基内)の局所eQTLsにより有意に媒介されるpcGeneの遠位(>1メガ塩基)発現量的形質遺伝子座(eQTLs)を分類した。300仲介ncRNAs以上を見出し,結合pcGeneが免疫調節及び細胞組織化経路に富んでいることを示した。共局在と遺伝的調節発現分析によりeQTLと癌GWAS結果を統合することにより,9つの既知の乳癌遺伝子座と1つの既知の前立腺癌遺伝子座と複数の新しい遺伝的関連における重複シグナルを検出した。著者らの結果は,癌病因に対する意味を持つ乳房および前立腺組織におけるncRNAの強い転写影響を示唆する。より広く,このフレームワークは,トランス機構を介し転写を遠位に調節する遺伝的変異体を特性化するため,機能的ゲノム特徴に系統的に応用できる。SIGNIFICANCは,トランス経路における遺伝子発現を潜在的に調節し,乳癌感受性に対する遺伝的シグナルと重複する非コードRNAを同定し,癌ゲノムワイド関連研究の解釈に意味がある。【JST・京大機械翻訳】

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腫ようの化学・生化学・病理学 , 泌尿生殖器の腫よう

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