プレプリント
J-GLOBAL ID:202202206200366753   整理番号:22P0247314

機能的ゲノミクスレベルでのヒト-マウス保存のゲノムワイドスコアの学習【JST・京大機械翻訳】

Learning a genome-wide score of human-mouse conservation at the functional genomics level
著者 (2件):
資料名:
発行年: 2020年09月09日  プレプリントサーバーでの情報更新日: 2020年09月09日
JST資料番号: O7001B  資料種別: プレプリント
記事区分: プレプリント  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
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抄録/ポイント:
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ヒトとマウスの間に保存されている機能的ゲノム特性を有するゲノム領域の同定は,マウスモデル研究との関連で重要な課題である。これに取り組むために,著者らは,エピゲノム,転写因子結合,およびヒトとマウスのトランスクリプトームデータの統合における大規模情報を統合することにより,機能的ゲノムレベルでの保存の証拠のスコアを学習する。著者らが開発した計算方法は,統合機能ゲノム注釈(LECIF)からの保存の証拠を学習し,ニューラルネットワークを訓練し,次にヒトとマウスのゲノムワイドスコアを生成するのに用いた。得られたLECIFスコアは,共有機能的ゲノム特性を有するヒトおよびマウス領域を明らかにし,そのような情報を明示的に与えなくても,生物学的に類似のヒトおよびマウスアノテーションの対応を捉えた。LECIFはマウスモデル研究の資源である。【JST・京大機械翻訳】
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, 【Automatic Indexing@JST】
分類 (2件):
分類
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遺伝子発現  ,  遺伝子の構造と化学 
タイトルに関連する用語 (5件):
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