卵巣トランスクリプトームの解析は昆虫ベクターRhodnius prolixusにおける新規遺伝子の探索を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Coelho, V. L.; Brito, T. F. d.; Brito, I. A. d. A.; Cardoso, M. A.; Berni, M. A.; Araujo, H. M. M.; Sammeth, M.; Pane, A.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202206222572969 整理番号：22P0251236

卵巣トランスクリプトームの解析は昆虫ベクターRhodnius prolixusにおける新規遺伝子の探索を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Analysis of ovarian transcriptomes reveals thousands of novel genes in the insect vector Rhodnius prolixus

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発行年： 2020年10月22日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年10月22日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

※このプレプリント論文は学術誌に掲載済みです。なお、学術誌掲載の際には一部内容が変更されている可能性があります。

Rhodnius prolixusはTriatominae昆虫種であり,Chagas病の一次ベクターである。R.prolixusのゲノムは,最近配列決定され,部分的に組み立てられているが,今までのトランスクリプトーム解析はほとんど行われていない。本研究では,卵形成と成熟卵の卵黄形成期から得られたステージ特異的トランスクリプトームについて述べた。 ̄228百万対末端RNA-Seq読取を分析することによって,9,206遺伝子に対する現在のゲノムアノテーションを著しく改善した。拡張5および3UTR,完全なOpen Reading Framesおよび代替転写物変異体を提供した。ゲノム誘導およびde novoトランスクリプトーム集合の組み合わせを用いて,2千以上の新規遺伝子を見出し,R.prolixusの遺伝子の数を15738から17,864に増加させた。R.prolixus卵形成中のステージ特異的遺伝子発現プロファイルを調べるために,改良トランスクリプトームを用いた。著者らのデータは,11,127の遺伝子が卵形成の初期前卵黄形成段階で発現し,それらの転写産物が生殖系列発生,ゲノム完全性,および母性接合体移行を調節する主要因子を含む発育中の卵に沈着することを明らかにする。さらに,GO用語分析は,ステロイドホルモン受容体経路,細胞骨格,および細胞内シグナル伝達の構成要素をコードする転写産物が成熟卵において豊富であり,そこで受精時の初期胚発生を制御する可能性があることを示す。著者らの結果は,R.prolixusゲノムとトランスクリプトームを有意に改善し,この医学的に関連する昆虫における卵形成と初期胚発生への新しい洞察を提供する。【JST・京大機械翻訳】

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遺伝子発現

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