フランスのSARS-CoV-2変異体の出現,拡散および消失はRNAウイルス流行の運命とBlack Queenルールに従う【JST・京大機械翻訳】

Colson, P.; Gautret, p.; Delerce, J.; Chaudet, H.; Pontarotti, P.; Forterre, P.; Tola, R.; Bedotto, M.; Delorme, L.; LEVASSEUR, A.; Lagier, J.-C.; Million, M.; Yahi, N.; Fantini, J.; La Scola, B.; Fournier, P.-E.; Raoult, D.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202206253251826 整理番号：22P0034062

フランスのSARS-CoV-2変異体の出現,拡散および消失はRNAウイルス流行の運命とBlack Queenルールに従う【JST・京大機械翻訳】

The emergence, spread and vanishing of a French SARS-CoV-2 variant exemplifies the fate of RNA virus epidemics and obeys the Black Queen rule

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発行年： 2022年01月08日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年01月08日
JST資料番号： O7002B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

連続した波を引き起こすSARS-CoV-2変異体の出現,広がりおよび消失に関連した変異の性質および動力学は,複合体1-5である。2020年7月のその発症以来,10か月間の最も一般的なフランス変異体(”Marseille-4”)の動力学を決定した。ここでは,次世代配列決定により得られた亜変異体および系統7453ゲノムを分析し,分類した。少なくとも50のゲノムとMarseille-4Bの22の異なる系統を含む2つの亜変異体,Marseille-4Aを同定した。それらの平均寿命は4.1{+/-}1.4か月であり,4.1{+/-}2.6変異が蓄積した。成長速度は0.079{+/-}0.045で,0.010から0.173まで変化した。すべての系統は「ガンマ」分布を示した。非予測部位におけるいくつかの有益な突然変異は,新しい発生を開始させたが,他の変異の蓄積は,より多くのウイルス異質性,多様性の増加および系統の消失をもたらした。Marseille-4Bは,他のMarseille-4系統が消失したときに出現した。そのORF8遺伝子は,いくつかのミンク系統およびα変異体で報告されているように,停止コドンによりノックアウトされた。この亜変異は入院と死亡率の増加と関連し,ORF8が非病原性遺伝子であることを示唆した。系統の観察された異質性は発生の終わりを予測するかもしれないと推測した。【JST・京大機械翻訳】

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感染症・寄生虫症一般 , ウイルスの生化学 , 遺伝子の構造と化学

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