プロテオーム拘束は栄養リッチ環境における微生物適応度を改善するための標的を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Chen, Y.; Pelt-KleinJan, E. v.; Olst, B. v.; Douwenga, S.; Boeren, S.; Bachmann, H.; Molenaar, D.; Nielsen, J.; Teusink, B.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202206409126091 整理番号：22P0250589

プロテオーム拘束は栄養リッチ環境における微生物適応度を改善するための標的を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Proteome constraints reveal targets for improving microbial fitness in nutrient-rich environments

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発行年： 2020年10月16日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年10月16日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

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細胞は,最大適応度に対する代謝とストレス耐性を調整する遺伝子発現を介して異なる条件に適応する。細胞プロテオームの制約は,そのような発現戦略を制限し,トレードオフ1;プロテオーム制約下の資源配分は,細菌2における調節戦略を説明する強力なパラダイムとして浮上している。しかし,これらの制約が,特に栄養豊富な条件下で進化した微生物,即ち,乳酸菌Lactococcus lactisのような複数の利用可能な窒素源,の進化変化を予測することができるかどうかは不明である。ここでは,遺伝子発現過程および関連する制約を明確に説明する,L.lactis(pcLactis)のプロテオーム制約ゲノムスケール代謝モデルと実験データの統合から好ましい栄養素を同定する方法を示した。グルコース制限ケモスタットデータ3を用いて,主要な制約としてグルコースとアルギニンの取り込みを同定し,その経路蛋白質は進化変異体で実際にアップレギュレートされた。しかし,増殖速度0.5h ̄-1以上で,pcLactisは,利用可能な酵素がそれらの最大容量で機能し,これは,主にアルギニン代謝で観察されるように,代謝フラックスを変化させる遺伝子発現を変化させることによってのみ増殖速度の増加を可能にすることを示唆する。したがって,プロテオーム制約モデルによるフラックスとプロテオミクスデータの統合的分析は,栄養豊富な成長環境における調節と適応度改善の標的を形成する制約を同定,説明することができる。【JST・京大機械翻訳】

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遺伝子発現 , 代謝と栄養

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