酸化ストレスに対するペントースリン酸経路応答の定量的モデリングは協調的規制戦略を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Hurbain, J.; Thommen, Q.; Anquez, F.; Pfeuty, B.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202206435031783 整理番号：22P0314364

酸化ストレスに対するペントースリン酸経路応答の定量的モデリングは協調的規制戦略を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Quantitative modeling of pentose phosphate pathway response to oxidative stress reveals a cooperative regulatory strategy

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発行年： 2022年02月06日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年02月06日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

生細胞は環境ストレスに適応するためにシグナル伝達と調節機構を使用する。例えば過酸化水素曝露による酸化ストレスの場合,適応応答は解糖およびペントースリン酸経路(PPP)の両者における酵素の同時調節に依存し,PPP依存性NADPHおよび酸化還元ホメオスタシスを支持した。初期酸化ストレス応答の基礎となる調節論理を理解するために,利用可能なメタボロミクスと ̄13Cフラックスミクスデータセットを用いて,動力学モデルの確率的アンサンブルを推測した。パラメータ分布,過渡動力学,用量反応曲線および機能喪失表現型のモデルアンサンブル特性は,初期酸化応答におけるG6PD,PGIおよびGAPDのアロステリック調節の有意で協調的効果を強調する。実際,PPPへの効率的なフラックス再経路選定は,アップレギュレートされたG6PD酵素と増加したG6P代謝産物の間の用量依存的協調を必要とすることを示し,後者は,上方およびより低い解糖酵素の微調整阻害を必要とする。アロステリック調節のこのセットはまた,6PGD調節に関連する例に対して逆説的摂動表現型を生成する傾向がある微妙な様式で負のフィードバックループと正のフィードバックループを組み合わせる。【JST・京大機械翻訳】

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代謝と栄養 , 生体防御と免疫系一般

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