高感度病原体検出によるヒト好中球における初期宿主クロマチン接近性応答の統合プロファイリング【JST・京大機械翻訳】

Ram-Mohan, N.; Thair, S.; Litzenburger, U.; Cogill, S. B.; Andini, N.; Yang, X.; Chang, H.; Yang, S. S.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202206473643520 整理番号：22P0233151

高感度病原体検出によるヒト好中球における初期宿主クロマチン接近性応答の統合プロファイリング【JST・京大機械翻訳】

Integrative profiling of early host chromatin accessibility responses in human neutrophils with sensitive pathogen detection.

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発行年： 2020年04月30日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年04月30日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

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Sepsisは,好中球が厳密に制御された抗菌エフェクターを介して病原体に応答する,世界的に主要な死因である。初期好中球応答と病原体検出の組み合わせは,疾患認識に対する洞察を明らかにする。6toll様受容体リガンドと2つの生物でチャレンジしたヒト好中球のATAC-seqを実施した。大腸菌(EC)曝露後のRNA-seqは,ATAC-seqと共に1および4時間暴露した。神経親のATAC-seqは,標準ライブラリー調製方法より,より病原性のDNA読取りを保持する。差次的クロマチン領域の一部だけが,課題の間に重複する。リガンドには共有シグネチャが存在するが,静止は位置,機能,および課題において独特である。エピゲノム変化はプラスチックであり,[ ̄]500だけがECチャレンジにより時間的に共有され,異なる遺伝子と関連プロセスをもたらす。また,それらの相対位置に基づくクロマチン媒介遺伝子調節の3つのクラスを同定した。これらおよび転写因子フットプリントは,好中球における転写調節のタイムリーで,特異的な機構を明らかにする。【JST・京大機械翻訳】

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免疫反応一般 , 感染免疫

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