あなた自身を発現する:Pseudomonas aeruginosaにおける迅速な染色体抗菌薬耐性検出のための定量的リアルタイムPCRアッセイ【JST・京大機械翻訳】

Madden, D. E.; Olagoke, O.; Baird, T.; Neill, J.; Ramsay, K. A.; Fraser, T. A.; Bell, S. C.; Sarovich, D. S.; Price, E. P.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202206558101816 整理番号：22P0320264

あなた自身を発現する:Pseudomonas aeruginosaにおける迅速な染色体抗菌薬耐性検出のための定量的リアルタイムPCRアッセイ【JST・京大機械翻訳】

Express yourself: Quantitative real-time PCR assays for rapid chromosomal antimicrobial resistance detection in Pseudomonas aeruginosa

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発行年： 2022年03月21日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月21日
JST資料番号： O7002B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

抗菌剤耐性(AMR)細菌の上昇は世界的な健康緊急である。この流行のタックリングにおける一つの重要なファセットは,緑膿菌のような重篤な多剤耐性病原体におけるより迅速なAMR診断である。ここでは,染色体コードAMRと通常関連する,耐性-根粒形成-分割流出ポンプMexAB-OprM,MexCD-OprJ,MexEF-OprN,MexXY-OprM,AmpC{β}-ラクタマーゼ,およびポリンOprDの差次的発現を同時に検出する2つの多重定量リアルタイムPCR(qPCR)アッセイを設計し,検証した。次に,qPCRsを,in vivoでAMRプロファイルを決定するために,P.aeruginosa呼吸器感染症の11人の参加者から15のsputaで試験した。著者らは,in vivo AMR診断における重要な進歩を表す,sputaに直接多重qPCR試験の実現可能性を確認した。特に,Luria-Bertaniブロス({+/-}2.5%NaCl)または5-抗生物質カクテルで増殖したそれらの派生分離株とのsputaの比較は,顕著な発現差を示し,in vitroでのin vivo発現プロファイルの複製の困難さを示した。嚢胞性線維症スプタは,フルオロキノロンおよびアミノグリコシド耐性株を有するにもかかわらず,慢性閉塞性肺疾患sputaと比較して,mexEおよびmexY発現の有意な低下を示し,これらの遺伝子座がin vivoでAMRに寄与しないことを示した。oprDは,同時性カルバペネム使用がない場合でさえ,嚢胞性線維症スプタにおいて有意にダウンレギュレートされ,カルバペネム有効性に影響を及ぼす可能性がある慢性感染における一般的適応形質を示唆した。Sutum ampC発現は,カルバペネム(6.7~15x)を受けた参加者で最も高く,その幾つかは,同時にセファロスポリンを受け,後者は,アップレギュレートされたampCにより無効になる。本qPCRアッセイはP.aeruginosaレジストームに貴重な洞察を提供し,臨床検体へのそれらの使用は患者の転帰と抗菌の向精神措置を改善するタイムリーな治療変更を可能にするであろう。【JST・京大機械翻訳】

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微生物検査法 , 病原体に作用する抗生物質の基礎研究

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