ABPP-HT ̄*-Depは高度DIA質量分析法を用いた脱ユビキチン化酵素の活性ベースプロファイリングのための高速に合致する【JST・京大機械翻訳】

Jones, H. B. L.; Heilig, R.; Davis, S.; Fisher, R.; Kessler, B. M.; Pinto-Fernandez, A.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202206806953603 整理番号：22P0315757

ABPP-HT ̄*-Depは高度DIA質量分析法を用いた脱ユビキチン化酵素の活性ベースプロファイリングのための高速に合致する【JST・京大機械翻訳】

ABPP-HT* - Deep meets fast for activity-based profiling of deubiquitylating enzymes using advanced DIA mass spectrometry methods

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発行年： 2022年02月21日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年02月21日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

活性に基づく蛋白質プロファイリング(ABPP)は,活性に基づく化学プローブと質量分析(MS)の組み合わせを用い,特定の酵素または酵素クラスを選択的に特性化する。ABPPは,薬物発見における酵素阻害剤のプロファイリングに貴重であることが証明されている。細胞抽出物および細胞に適用した場合,小分子とのABP-酵素複合体形成は,効力,選択性,可逆性/結合親和性,透過性および安定性を同時に知らせる。ABPPは,in vivoモデルに適用した場合,特異的器官内の細胞標的関与を知らせるための薬力学的研究にも応用できる。最近,著者らは,脱ユビキチン化酵素(DUB)のプロファイリングのための分離高深度および高スループットABPP(ABPP-HT)プロトコルを確立した。しかし,1つの方法で,2つの,深い,そして,速い組合せは,分かりにくい。現在のABPP-HTワークフローの感度をさらに高めるために,最先端のデータ独立取得(DIA)とデータ依存取得(DDA)MS分析ツールを実行した。ここでは,DIA MS法と組み合わせた改良方法論,ABPP-HT*(増強高スループット-適合性活性に基づく蛋白質プロファイリング)を,35-40DUBの一貫したプロファイリングを可能にし,1日あたり100試料のスループットを維持しながら,欠損値の減少数を提供した。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , , , , 【Automatic Indexing@JST】

酵素一般 , 酵素製剤・酵素阻害剤の基礎研究 , 生化学的分析法

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