フルシブQTL:異系交配種の二親集団におけるQTLマッピングのためのRパッケージ【JST・京大機械翻訳】

Gazaffi, R.; Amadeu, R. R.; Mollinari, M.; Rosa, J. R. B. F.; Taniguti, C. H.; Margarido, G. R. A.; Garcia, A. A. F.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202206808222096 整理番号：22P0254939

フルシブQTL:異系交配種の二親集団におけるQTLマッピングのためのRパッケージ【JST・京大機械翻訳】

fullsibQTL: an R package for QTL mapping in biparental populations of outcrossing species

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発行年： 2020年12月07日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年12月07日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

外来種における正確なQTLマッピングは,異なる分離パターンおよび異なるレベルの情報を有するマーカーのような,これらの集団の遺伝的特徴を考慮するソフトウェアプログラムを必要とする。今日までの利用可能なマッピング手順は,QTL位置と効果を与えることができるが,それらは大部分は多遺伝子座遺伝地図に基づくものではない。そのようなマップに基づくQTL解析が,それらが地図のより少ない情報間隔に情報を伝播する有益なマーカーを可能にするので,重要である。異なる分離パターンを持つ交差集団とマーカーを考慮して,複合区間QTLマッピングを行う新規で自由に利用可能なRパッケージであるフルシブQTLを開発した。それは,QTL位置,効果,分離パターン,および隣接マーカーとの連鎖相の推定を可能にする。さらに,直接解析と解釈のために,いくつかの統計的およびグラフィカルツールを実装し,CとRソースコード(GPLv3)を有するRオープンソースパッケージである。それはマルチプラットフォームであり,https://github.com/augusto garcia/fullsibQTLから設置できる。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , 【Automatic Indexing@JST】

遺伝子の構造と化学

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