CAR mRNA相互作用表面はリボソームA部位のジッパー伸長である【JST・京大機械翻訳】

Dalgarno, C.; Scopino, K.; Raval, M.; Nachmanoff, C.; Sakkas, E.; Krizanc, D.; Thayer, K.; Weir, M. P.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202206929880660 整理番号：22P0031844

CAR mRNA相互作用表面はリボソームA部位のジッパー伸長である【JST・京大機械翻訳】

The CAR mRNA-Interaction Surface is a Zipper Extension of the Ribosome A Site

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発行年： 2022年01月06日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年01月06日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

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リボソームCAR相互作用表面は,解読中心A部位の伸長のように挙動し,A部位に入るのに次ぐ+1コドンとのH結合相互作用を有する。分子動力学シミュレーションにより,このCAR-mRNA相互作用のコドン配列特異性を調べ,GCNコドンに対する強い優先性を発見し,CAR相互作用表面に依存する翻訳調節の配列依存性層が存在することを示唆した。ヌクレオチド置換実験によるCAR-mRNA相互作用の切断は,+1コドンの最初のヌクレオチドが,CAR-mRNA界面を介してA部位からエマネートするエネルギー的に有利なジッパー様活性と一致して,第2ヌクレオチド位置より優位を占めることを示した。+1コドン/CAR相互作用はGとCのスタッキングに影響する+1GCNコドンのヌクレオチド3の同一性によっても影響を受けた。クラスタ分析は,Aサイト復号化センターが+1コドンの同一性に依存する異なる近隣部分状態を採用することを示唆する。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , 【Automatic Indexing@JST】

遺伝子発現 , 核酸一般

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