抄録/ポイント：
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パセリン由来のSalmonella enterica血清型Typhimuriumは,ヨーロッパ,Oceaniaおよび北アメリカにおいて野生鳥死亡率およびヒトサルモネラ症発生を引き起こしている。ここでは,地理的に分散したパズセリン分離株の出現,遺伝的関係および進化を調べるために比較ゲノム解析を行った。ヨーロッパとアメリカのパセセリン分離株は,他の多様な宿主(例えば,ヒト,ウシ,ブタ,ニワトリ,ハトやアヒルのような他の鳥類宿主)で循環する主要なS.Typhimurium系統とは異なる2つの系統(EUとUSパセリン系統)を形成することを見出した。さらに,ニュージーランドのパセリン分離株は,USパセリン系統の亜系統(NZパセリン系統)を形成するようにクラスタ化した。pasセリン分離株が3.2x10 ̄-7置換/部位/年の割合で変異し,US,EU,およびNZパセリン系統がそれぞれ約1952,1970,および1996年に出現したと推測した。3つの系統からの分離株は,抗菌耐性遺伝子の欠如および同じ病原性偽遺伝子の蓄積のような遺伝的類似性を示した。さらに,微小進化による遺伝的多様性は3つのパセリン系統に存在した。特に,1型線毛遺伝子fimC(87位のG欠失)における偽遺伝は,USおよびNZパセリン分離株でのみ検出されたが,タイプ3分泌系エフェクター遺伝子(すなわち,gogB,sseJおよびsseK2)における単一塩基欠失は,EUパセリン分離株においてのみ起こった。これらの知見は,パセリンにおけるS.Typhimuriumの進化,宿主適応および疫学への洞察を提供する。IMPORTANCEPasセリン関連S.Typhimuriumは,近年,ヒトサルモネラ症発生と関連している。ここでは,世界的に分布したパセリン分離株の系統発生関係を調べ,それらのゲノム類似性と多様性をプロファイル化した。本研究は,ヨーロッパ,Oceaniaおよび北アメリカで循環する2つのパセリン関連S.Typhimurium系統を明らかにした。2つの系統からの分離株は,他の宿主の分離株とは異なる系統発生および遺伝的特徴を示した。所見は,パセリンにおけるS.Typhimuriumの宿主適応に光を当て,鳥宿主へのS.Typhimuriumの発生源属性に重要である。さらに,ニュージーランドとオーストラリアで10年長のヒトサルモネラ症発生を引き起こすパセリンからのS.Typhimuriumの決定的ファージタイプ(DT)160が,USパセリン系統の亜系統を形成し,DT160がOceania外のパセリンに由来する可能性があることを示唆した。本研究は,現代の疫学調査への歴史的微生物収集の全ゲノム配列決定とゲノム分析の重要性を示した。【JST・京大機械翻訳】
