地球移動距離(STARSEED)による根系分布の空間的およびテクスチャ解析【JST・京大機械翻訳】

Peeples, J.; Xu, W.; Gloaguen, R.; Rowland, D.; Zare, A.; Brym, Z.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202207261438850 整理番号：21P0265211

地球移動距離(STARSEED)による根系分布の空間的およびテクスチャ解析【JST・京大機械翻訳】

Spatial and Texture Analysis of Root System Distribution with Earth Mover's Distance (STARSEED)

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発行年： 2022年12月13日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年12月13日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

目的:根系アーキテクチャは複雑で,農業および生態学的発見のために効果的に特性化する。方法:地球上の距離(EMD)の新しい適用を通して空間情報を組み込む根系分布を比較するため,地球上の距離(STARSEED)による根SystEm分布の新しい方法,空間およびテクスチャ解析を提案する。結果:この手法は,異なる遺伝子型と土壌水分レベルに対するゴマ根系の応答を捕捉することを示した。STARSEEDは,実験処理を通して根構造で生じる変化への定量的および視覚的洞察を提供する。結論:STARSEEDは,他の植物に一般化でき,根系アーキテクチャ開発と,既存の根構造計量とモデルによって捉えられない成長条件の変化に対する応答への洞察を提供する。著者らの実験のコードとデータは,公的に利用可能である:ウルル{https://github.com/GatorSense/STARSEED。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , 【Automatic Indexing@JST】

遺伝子発現 , 微生物の生態 , 植物に対する影響

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