可逆化学反応ネットワークの二項性試験のためのグラフ理論的アプローチ【JST・京大機械翻訳】

Rahkooy Hamid; Montero Cristian Vargas

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202207389704758 整理番号：21P0056481

可逆化学反応ネットワークの二項性試験のためのグラフ理論的アプローチ【JST・京大機械翻訳】

A Graph Theoretical Approach for Testing Binomiality of Reversible Chemical Reaction Networks

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発行年： 2020年10月23日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2021年01月14日
JST資料番号： O7000B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

化学反応ネットワークの定常状態理想の二項性を研究した。不確定要素として速度定数を考慮して,無条件二項性の概念を導入し,線形代数に基づくアルゴリズムを,可逆化学反応ネットワークのための最近の研究で提案し,そしてそれは,種および反応の数に関して,多項式時間複雑性上界を持った。本論文では,種-反応グラフの修正版を用いて,エッジを付加し,削除し,無条件二項性をテストするためにエッジのラベルを変更することにより,グラフ理論に基づくアルゴリズムを提案した。Mapleにおける線形代数アルゴリズムと同様にグラフ理論アルゴリズムを実装し,生化学モデルに関する実験を行った。著者らの実験は,グラフ理論的アプローチの性能が線形代数方式と同等か,またはより良いことを示したが,それはGroebner基底と量子化器除去方法よりはるかに高速であった。【JST・京大機械翻訳】

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グラフ理論基礎

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