ドメイン蛋白質複合体とトポロジー特性に基づく蛋白質を同定するための2つの新しい方法【JST・京大機械翻訳】

Lu Pengli; Yu JingJuan

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202207681729109 整理番号：22P0120508

ドメイン蛋白質複合体とトポロジー特性に基づく蛋白質を同定するための2つの新しい方法【JST・京大機械翻訳】

Two new methods for identifying proteins based on the domain protein complexes and topological properties

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発行年： 2020年03月07日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年03月07日
JST資料番号： O7000B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

必須蛋白質の認識は,細胞操作の機構を理解するのに役立つだけでなく,生物学的進化の機構の研究にも役立つ。現在,多くの学者が蛋白質ネットワークと複合体のトポロジー構造に従って必須蛋白質を発見する。一方,いくつかの蛋白質はまだ認識できない。本論文では,蛋白質の必須性を決定するために,蛋白質複合体の局所特性とトポロジー特性を統合する,2つの新しい方法,複素度中心度(CDC)と複雑なインテグリティと中間度定義(CIBD)を提案した。最初に,蛋白質複合体の特性を記述する複雑な平均中心度(CAC)と複雑なハイブリッド中心性(CHC)の定義を与えた。次に,CACとCHC定義に基づくこれらの新しい方法CDCとCIBDを提案する。これらの2つの方法にアクセスするために,Saccharomyces cerevisiae,DIP,MIPSおよびYMBDの異なる蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)ネットワークを実験材料として使用した。ネットワークの実験結果は,CDCとCIBDの方法が,必須蛋白質を予測する精度を改善するのを助けることができることを示す。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , 【Automatic Indexing@JST】

蛋白質・ペプチド一般 , 分子・遺伝情報処理

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