プレプリント
J-GLOBAL ID:202202207832152917   整理番号:21P0273624

長いテロメアオーバーハングにおける出現するアクセシビリティパターン【JST・京大機械翻訳】

Emerging Accessibility Patterns in Long Telomeric Overhangs
著者 (7件):
資料名:
発行年: 2022年05月24日  プレプリントサーバーでの情報更新日: 2022年05月24日
JST資料番号: O7001B  資料種別: プレプリント
記事区分: プレプリント  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
抄録/ポイント:
抄録/ポイント
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生理学的関連長のヒトテロメアオーバーハングのアクセシビリティを調べる単一分子実験及び計算モデリング研究を提示した。GGGTA(G-Trac)配列の4-28反復を含む25の異なるオーバーハングを研究し,1-7タンデムG-四重鎖(GQ)構造を収容した。FRET-PAINT法を用いて,G-Tractに相補的であり,利用可能な部位に一時的に結合する短いイメージャ鎖を介してアクセス可能な部位の分布を調べた。オーバーハング長で周期的に変化するアクセシビリティパターンを報告し,基礎となる折畳み景観と折畳みフラストレーションに関してこれらのパターンを説明した。[4n]G-Tracts(12,16,20..)を有するオーバーハングは,PNAプローブがオーバーハングを通してG-Tracsをアクセスする最も広いアクセシビリティパターンを示す。一方,[4n+2]G-Tracs,(14,18,22.)を有する構築物は,単一と二本鎖テロメア間の接合の近傍が最も接近しやすい狭いパターンを持つ。これらの結果を,[4n]G-Trac構築物に比べて[4n]G-Trac構築物でより高い折畳みフラストレーションとして解釈する。また,観測されたアクセシビリティパターンを有する隣接GQ間の異なる折りたたみ安定性と協同性の一貫性をテストする計算モデルを開発した。著者らの実験および計算研究は,単一および二本鎖テロメア間の接合の近傍が最小安定性で,最も接近しやすく,これはPOT1/TPP1(一本鎖テロメアに結合した)と他のシェルタリン蛋白質(二本鎖テロメア上に局在)の間の結合が確立された潜在的部位であると,この点が確立していることを示唆するものである.。” この報告は,最も安定的で,最も接近可能であることを示唆するものである.このことは,この点がPOT1/TPP1(一本鎖テロメアに結合した)と他のシェルタリン蛋白質(二重鎖テロメア上に局在する)との連結が確立される可能性があることである。真核生物線形染色体の末端は,一本鎖オーバーハングで終わるテロメアによりキャップされる。テロメアオーバーハングは,これらの重要なゲノム部位へのアクセスを阻害するG-四重螺旋と呼ばれるコンパクトな構造に折りたたまれる。生理学的に関連する長さ尺度のかなりの部分をカバーする一連のヒトテロメアオーバーハングのアクセシビリティを調べる単一分子測定と計算モデリング研究を報告する。明確な周期性を持つ新しいアクセシビリティパターンを観察し,ある領域が他よりも著しく接近しやすいことを示した。これらのアクセシビリティパターンも,G四重鎖の根底にある折畳みフラストレーションがテロメア長に依存することを示唆する。これらのパターンは,テロメアオーバーハングを標的にするDNAプロセシング酵素およびDNA結合蛋白質のアクセスを調節するための重要な意味を持つ。【JST・京大機械翻訳】
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分類 (1件):
分類
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核酸一般 

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