SARS-CoV-2 ORF3aのD155Y置換はカベオリン-1との結合を弱める【JST・京大機械翻訳】

Gupta, S.; Mallick, D.; Banerjee, K.; Mukherjee, S.; Sarkar, S.; Lee, S. T. M.; Basuchowdhuri, P.; Jana, S. S.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202208068003240 整理番号：21P0249372

SARS-CoV-2 ORF3aのD155Y置換はカベオリン-1との結合を弱める【JST・京大機械翻訳】

D155Y Substitution of SARS-CoV-2 ORF3a Weakens Binding with Caveolin-1

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発行年： 2022年02月01日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年02月01日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

※このプレプリント論文は学術誌に掲載済みです。なお、学術誌掲載の際には一部内容が変更されている可能性があります。

新規SARS-CoV-2ウイルスに起因する最近の流行性COVID-19の臨床症状は,軽度から重度の呼吸器疾患まで変化する。環境,人口統計および共存因子は,疾患の重症度に影響するが,重症度の程度に対するウイルス遺伝子の各々の変異の寄与は,COVID-19に対するより良い治療方法を設計するためのより深い理解を必要とする。オープンリーディングフレーム-3a(ORF3a)蛋白質は,いくつかの位置で変異することが見出されている。本研究では,インドのCOVID-19患者で見出されたORF3a蛋白質のD155Yの最も高頻度に発生する変異体の1つの影響を調べた。コンピューターシミュレーションを用いて,155番目の置換が,塩橋形成,水素結合占有,インタラクトームクラスタ,およびインド人患者に見られる他の置換と比較して,蛋白質の安定性に関与するアミノ酸を変化したことを示した。HADDOCK分析を用いた蛋白質-蛋白質ドッキングは,置換D155Yが他の置換と比較してカベオリン-1とORF3aの結合親和性を弱め,これはSARS-CoV-2の病原性特性を調節する可能性のあるORF3a-カベオリン-1複合体の全体的な安定性におけるその重要性を示唆する。【JST・京大機械翻訳】

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ウイルス感染の生理と病原性

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