きょく皮動物のRNAビローム【JST・京大機械翻訳】

Jackson, E. W.; Wilhelm, R. C.; Buckley, D. H.; Hewson, I.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202208076534149 整理番号：22P0316849

きょく皮動物のRNAビローム【JST・京大機械翻訳】

The RNA Virome of Echinoderms

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発行年： 2022年03月02日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月02日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

Echinodermは,モデル生物,キーストーン種,および海産物のために商業的に収穫された動物を含む海洋無脊椎動物の門である。それらの科学的,生態学的および経済的重要性にもかかわらず,他の無脊椎動物と比較して棘皮動物に感染するRNAウイルスの多様性についてはほとんど知られていない。著者らは,900のトランスクリプトームとウイルスメタゲノムを選別し,全5つのクラス(Crinoidea,Holthuroidea,Aステロイドea,OphiuroideaとEchinoidea)から38の棘皮種のRNAウイルスを特徴づけた。9つのウイルス配列-Picornavirales,Durnavirales,Martellivirus,Nodamuvirus,Reovirus,Amarillovirus,Ghabrvirus,Mononegavirus,およびHepelivirusの属と科に分類される347のウイルスゲノム断片を同定した。3つのライフステージ(胚,幼虫,成虫)にわたる相対的なウイルス表現を比較し,完全またはほぼ完全なゲノムをコードするコンティグの遺伝子含有量を特性化した。与えられたトランスクリプトームにおけるウイルス読取の比率は,大部分のウイルスコンティグが成体組織のトランスクリプトームから発見されたが,ライフステージ間で有意に異なるとは見出されなかった。本研究は,棘皮からのRNAウイルスの生物多様性を明らかにし,自然個体群におけるウイルス群の発生を明らかにした。【JST・京大機械翻訳】

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, , , 【Automatic Indexing@JST】

ウイルス学一般 , 遺伝子発現 , ウイルスの形態学,分類学 , 進化論一般

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