トランスクリプトーム解析のための骨格筋組織由来のミトコンドリアの精製は核コード非コードRNAの局在化を明らかにする【JST機械翻訳】

Silver, J.; Trewin, A. J.; Loke, S.; Croft, L.; Ziemann, M. J.; Soria, M.; Dillon, H.; Nielsen, S.; Lamon, S.; Wadley, G. D.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202208152953024 整理番号：22P0342955

トランスクリプトーム解析のための骨格筋組織由来のミトコンドリアの精製は核コード非コードRNAの局在化を明らかにする【JST機械翻訳】

Purification of mitochondria from skeletal muscle tissue for transcriptomic analyses reveals localisation of nuclear-encoded non-coding RNAs

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発行年： 2024年06月17日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2024年06月17日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

ミトコンドリアは細胞機能の中心であり,特に骨格筋のような代謝的に活性な組織においてそうである。核コードRNAは典型的に核及びサイトゾル内に局在するが,小集団はミトコンドリアのような細胞内コンパートメントに移動するらしい。骨格筋細胞及び組織のミトコンドリア内に局在する核コードRNAを調べた。無傷のミトコンドリアを免疫沈降(IP)により単離し,次いでミトコンドリアの外側に位置する転写物を除去するために最適化した酵素処理(RNアーゼA及びプロテイナーゼK)により,それをハイスループットトランスクリプトーム配列決定に適応させた。1.8ngのミトコンドリアRNA入力から小RNA配列ライブラリーの構築に成功した。ラット筋芽細胞由来のミトコンドリアの低分子RNAシークエンシングは200以上のmiRNAの濃縮を明らかにした。骨格筋組織からIPにより分離した酵素的に精製したミトコンドリアの全トランスクリプトームRNA配列決定は,ミトコンドリア外膜を欠くミトプラスト調製品と比較し,純度の著しい類似性を示した。要約すると,骨格筋ミトコンドリア内に局在する核コードRNA転写物の発見を促進する動物及びヒト組織及び細胞に適用できる新規で強力な配列決定法を示した。【JST機械翻訳】

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, , , , 【Automatic Indexing@JST】

遺伝子発現

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