下水管におけるコロナウイルスの崩壊と廃水監視に基づくSARS-CoV-2感染事例推定のための予測モデルの開発【JST・京大機械翻訳】

Fu, S.; Wang, Q.; He, F.; Zhou, C.; Zhang, J.; Xia, W.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202208176421490 整理番号：22P0321647

下水管におけるコロナウイルスの崩壊と廃水監視に基づくSARS-CoV-2感染事例推定のための予測モデルの開発【JST・京大機械翻訳】

The decay of coronavirus in sewage pipes and the development of a predictive model for the estimation of SARS-CoV-2 infection cases based on wastewater surveillance

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発行年： 2022年03月21日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月21日
JST資料番号： O7002B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

廃水監視は,廃水処理施設におけるウイルスを検出することによって,特定のコミュニティにおけるSARS-CoV-2のサイレント伝染を解明する有望なアプローチとして役立つ。本研究は,Xian市のYanta地区におけるCOVID-19発生中の1つのWWTPと3つのコミュニティにおけるウイルスRNA豊度を,12月2021日から1月2022日まで監視した。下水管におけるコロナウイルスの減衰をさらに理解するために,トリ感染性気管支炎ウイルス(IBV)を2つの再循環水システムに播種し,90日間運転した。Xianの廃水におけるウイルス豊度と下水管におけるコロナウイルスの減衰に関する上記のデータに基づいて,モンテカルロシミュレーションを実行して,Xianにおける感染性ケースを推定した。結果は,デルタ変異体が,臨床試料の既報告日より5日早くDec-10で最初に検出されたことを示唆した。SARS-CoV-2は,最初のケースより2日早くモニターされたコミュニティで12月18日に検出され,次の2つのサンプリング時間で連続的に検出された。生物膜のないパイプラインにおいて,結果は,高温が20kmの旅行距離を経験して,2.18log10GC/LによってウイルスRNA豊度を著しく減少させ,一方,1.68log10GC/L減少が,低い水温のパイプラインにおいて観察されたことを示した。90日間の運転の後,生物膜は両方のシステムでパイプラインで成熟した。2.14および4.79log10GC/LのウイルスRNA存在量の減少は,それぞれ成熟生物膜を有する低温および高温系で観察された。上記の結果に基づいて,著者らは,モンテカルロシミュレーションのための入力パラメータを調整し,それぞれ12月14,18,22および26における23.3,50.1,127.3および524.2の感染者を推定し,それは臨床報告と大きく整合した。本研究は,コミュニティと都市レベルの両方でCOVID-19の早期警戒のための廃水監視の実行可能性を強調し,それは臨床アプローチに対する貴重な補完である。【JST・京大機械翻訳】

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微生物検査法 , ウイルスによる動物の伝染病 , ウイルスの生理一般

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