幼生ゼブラフィッシュ脳の単一細胞分解能遺伝子発現地図【JST・京大機械翻訳】

Shainer, I.; Kuehn, E.; Laurell, E.; Al Kassar, M.; Mokayes, N.; Sherman, S.; Larsch, J.; Kunst, M.; Baier, H.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202208183290287 整理番号：22P0315032

幼生ゼブラフィッシュ脳の単一細胞分解能遺伝子発現地図【JST・京大機械翻訳】

A single-cell resolution gene expression atlas of the larval zebrafish brain

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発行年： 2022年02月11日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年02月11日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

多モード脳アラーゼの出現は,関心のある領域における細胞型,連結性および遺伝子発現のin silicoクエリを提供することにより,神経科学における発見を加速することを期待する。多重蛍光in situ RNAハイブリダイゼーション連鎖反応(HCR)を用いて,幼生ゼブラフィッシュ脳を横断する200マーカー遺伝子の初期セットに対する発現マップを作成した。データをMax Planck Zebrafish脳(mapze脳)アトラスに登録し,遺伝子発現パターン,単一ニューロン追跡,トランスジェニック系統および解剖学的セグメンテーションの共可視化を可能にした。さらに,自由遊泳幼虫の脳活性マップを,即時初期遺伝子cfosのHCR標識を用いて単一細胞解像度で発生させ,アトラスに統合した。概念の証明として,著者らは,カルブ2aを発現し,視床下部に投射し,最近摂取されている動物で活性化される,新しいクラスの小脳真核生物細胞を同定した。したがって,細胞解像度遺伝子発現地図は,関心のあるニューロン集団に対するマーカー遺伝子の迅速同定を助けるだけでなく,機能的活性マップおよびシナプス連結性に対する遺伝的情報を固定することにより,分子および回路レベルも橋渡しする。【JST・京大機械翻訳】

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, , 【Automatic Indexing@JST】

中枢神経系 , 遺伝子発現

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