抄録/ポイント：
抄録/ポイント
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動物飼育は,行動,発生および生殖のような多くの多遺伝子量的形質に典型的に影響した。しかし,量的形質変異の遺伝的基礎を明らかにすることは,おそらく小さな対立遺伝子-頻度変化に起因するので,困難である。今日まで,馴化過程に関連した少数の原因変異のみが報告されており,小さな影響変異体が顕著な役割を持つという仮説を強化した。今まで,家畜化に関する研究は,有害な変異および強い有益な変異体に対する家畜化のグローバルな影響の検出に限定されており,小さな選択的影響を有する変異体の重要性を無視している。さらに,特に非モデル生物において,欠損データの無視できない画分を含むゲノム配列に関して,選択の影響の研究が行われる。したがって,これらの位置を説明する適切な方法が必要である。これらの困難を克服するために,ここでは,サイト周波数スペクトル(SFS)を総括する変動性の推定に基づく漸近MacDonald-Kreitman(MK)法を用いて,有益な変異体の割合を推定し,一方,各母集団のFitness効果(DFE)の分布を推定するため,Approximate Bayes計算(ABC)解析を行うために,それらを使用した。このアプローチを3つの異なる個体群,1つの野生と2つの家庭からブタの46のゲノム配列に適用し,非常に異なる個体群統計学履歴と選択圧を示した。得られた結果は,国内および野生ブタ個体群が非同義固定変異で異なることを示した。したがって,品種間の推定の違いはそれらの多型により決定される。全および排他的変異の比較は,異なる国内個体群が,それらの機能的対中性多型比における最近の分岐的変化に悩まし,一方,野生集団は=0と互換性があることを示唆した。さらに,ABCで推論されたDFEは,野生および家庭のブタが,低頻度で多数の有害な変異と,国内および野生個体群の進化に重要な影響を与える可能性がある多数の中性および/またはほぼ中性の突然変異を示すことを示す。加えて,有益な変異を考慮しないモデルはより高い後部確率を有し,有益な変異が検出または不足していることを示唆する。実際,すべての3つの個体群について,強い好ましい突然変異の中央値は,正の選択を含むそれらのモデルにおいて非常に低い([≦]0.1%)であり,野生イノシシに対して0.6%付近の弱い有益な突然変異の平均値および家畜ブタに対して0.8~1.0%であった。最後に,排他的変異に基づく分析は,最近の人口統計的変化が,特に地域イベリア品種で,個体群の適応度に大きく影響することを示した。【JST・京大機械翻訳】
