核酸の機械的性質と非局所ねじれ可能なウオーム状鎖モデル【JST・京大機械翻訳】

Segers Midas; Voorspoels Aderik; Sakaue Takahiro; Carlon Enrico

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202208271238570 整理番号：22P0294118

核酸の機械的性質と非局所ねじれ可能なウオーム状鎖モデル【JST・京大機械翻訳】

Mechanical properties of Nucleic Acids and the non-local Twistable Wormlike Chain model

出版者サイト {{ this.onShowPLink() }} 複写サービスで全文入手
高度な検索・分析はJDreamⅢで

この文献はプレプリントです。プレプリントについてはこちらをご確認ください。

著者 (4件)： , , ,
資料名：
発行年： 2022年02月23日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年08月11日
JST資料番号： O7000B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

※このプレプリント論文は学術誌に掲載済みです。なお、学術誌掲載の際には一部内容が変更されている可能性があります。

核酸の機械的性質は,これらの分子の物理的変形をしばしば含む多くの生物学的プロセスにおいて重要な役割を果たす。十分に長い長さスケール(λ≧20-30塩基対)で,DNAとRNA二重螺旋の力学を,ねじれと曲げ剛性を特徴とする半柔軟性高分子モデルである,均一Twistable Wormlike鎖(TWLC)により記述した。より短いスケールでは,このモデルは2つの理由で破壊される:弾性特性は配列依存性になり,遠位部位での機械的変形は結合される。本論文では,非局所Twistable Wormlike連鎖(nlTWLC)のフレームワークを用いて,後者の効果の起源を検討した。DNAおよびRNA二重螺旋に対する全原子シミュレーションデータを比較することにより,非局所カップリングはこれら2分子において非常に類似した性質であり,遠位部位間の結合は傾斜およびねじれ自由度に対して強く,ロールに対しては弱いことを示した。この普遍的な遠位結合挙動の起源を明らかにする簡単な二本鎖ポリマーモデルを導入し,解析した。このモデルでは,ラダーモデルとして参照され,nlTWLC記述は,分子のねじれと曲げを記述する角度変数への局所(原子)自由度の粗大化から現れる。その局所対応物と異なり,nlTWLCは長さスケール依存性弾性によって特性化される。本解析は,核酸が数塩基対のスケールで機械的に軟らかく,より長い長さスケールで漸近的に硬く,実験データと一致する挙動を予測する。【JST・京大機械翻訳】

, , , , , , , , , , , ,
, , 【Automatic Indexing@JST】

核酸一般

, , , ,

前のページに戻る