プレプリント
J-GLOBAL ID:202202208682232611   整理番号:22P0316771

機械的除荷による不全ヒト心臓のゲノムワイドDNAメチル化プロファイリングは心筋細胞におけるカルシウム処理の必須調節因子としてLINC00881を同定する【JST・京大機械翻訳】

Genome-Wide DNA Methylation Profiling of the Failing Human Heart with Mechanical Unloading Identifies LINC00881 as an Essential Regulator of Calcium Handling in the Cardiomyocyte
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発行年: 2022年03月02日  プレプリントサーバーでの情報更新日: 2022年03月02日
JST資料番号: O7001B  資料種別: プレプリント
記事区分: プレプリント  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
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【背景】ヒト心不全は心筋DNAメチル化プロファイルにおける全体的変化によって特性化されるが,非コード転写産物の後成的調節および左室補助装置(LVAD)サポートによるDNAメチル化の潜在的可逆性についてはほとんど知られていない。方法:心筋DNAメチル化のゲノムワイドマッピングを,LVADインプラントの時点で末期心不全の36人の患者,LVAD移植片の時点での8人の患者,および高密度ビーズアレイプラットフォームを用いた7人の非固定対照で実施した。ヒト誘導多能性幹細胞由来心筋細胞(iPSC)においてトランスクリプトームおよび機能研究を行った。【結果】病因特異的分析は,虚血性心筋症(ICM)における2079の差別的メチル化位置(DMPs)と非虚血性心筋症(NICM)における261のDMPsを明らかにした。192のDMPsはICMとNICMに共通であった。LVAD支持前後の対試料の分析は,HF特異的DMPsの3.2%のみの逆メチル化を示した。メチル化-発現相関分析は,ICMおよびNICM患者において,低メチル化およびアップレギュレートされたいくつかの蛋白質コード遺伝子(HTRA1,FAM65A,FBXO16,EFCAB13,AKAP13,RPTOR)または過メチル化および下方制御(TBX3)を生じた。新規心臓特異的スーパーエンハンサーlncRNA(LINC00881)は,不全ヒト心臓で過メチル化され,ダウンレギュレートされる。LINC00881は,MYH6,CACNA1CおよびRYR2を含むサルコメアおよびカルシウムチャンネル遺伝子発現の上流レギュレーターである。LINC00881ノックダウンは,拍動ヒトiPSCにおけるピークカルシウム振幅を有意に減少させた。【結論】ヒト心臓をingめることは,コード化および非コード領域を含むDNAメチル化における病因特異的変化を示し,それは機械的負荷軽減で最小可逆性である。エピジェネティックリプログラミングは,心不全から転写正常化と持続的臨床回復を達成するために必要である。【JST・京大機械翻訳】
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分類 (2件):
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JSTが定めた文献の分類名称とコードです
遺伝子発現  ,  遺伝子の構造と化学 

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