ハイスループット単一細胞表現型による多面性の広がりと文脈依存性【JST・京大機械翻訳】

Kerry A Geiler-Samerotte; Shuang Li; Charalampos Lazaris; Austin Taylor; Naomi Ziv; Chelsea Ramjeawan; Annalise B Paaby; Mark L Siegal

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202208700603495 整理番号：22P0258212

ハイスループット単一細胞表現型による多面性の広がりと文脈依存性【JST・京大機械翻訳】

Extent and context dependence of pleiotropy revealed by high-throughput single-cell phenotyping

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発行年： 2020年07月09日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年07月09日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

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単一突然変異が複数の形質に影響するとき,Pleiotrophyは,遠い意味を持つ議論の主題である。Pleiotrophyは,複雑な形質がどのように進化し,生物系がモジュラであるか,あるいはあらゆる遺伝子が多くの形質に影響を及ぼす可能性があるように組織化されるかどうかについての議論において中心的役割を果たす。また,Pleiotrophyは,他者を犠牲にして増殖を促進する変異を選択することにより感染性微生物または腫瘍を捕獲する進化医学におけるイニシアティブに重要である。これらの分野における研究,および他は,ple食が,摂動(垂直食性)を関連しない表現型間の固有の関係を反映する程度の理解から利益を得るであろう。代りに,pleiotrophyは,他の独立した形質(水平な多栄養性)の間の相関を課す遺伝的変化から生じる可能性がある。酵母細胞のクローン集団を用いてこれらの可能性を識別し,単一細胞形態学的特徴間の固有の関係を定量化した。次に,これらの関係がどのようにして垂直のple食性の基礎になるか,また,これらの関係が水平なプライオトロピーを介して作用する遺伝的変異体(QTL)によってどのように修飾されるかを示す。著者らの包括的スクリーニングは,数千の酵母細胞にわたって,数千のペアワイズ形質相関を計測し,垂直および水平のプライオトロピーの両方の十分な証拠を明らかにした。さらに,形質間の相関は環境,遺伝的背景および細胞周期位置により変化することを観察した。これらの変化依存性から,生物学的システムは,与えられた状況において,限られたプレイオトロピーを示すが,文脈(例えば,多様な環境および遺伝的背景を通して)を通して,各遺伝的変化は,より多くの形質に影響を及ぼす可能性がある。著者らの方法は,進化医学における応用に対する栄養の利用が,文脈にあまり依存しない相関を有する形質に焦点を当てることから利益を得ることを示唆する。【JST・京大機械翻訳】

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分子遺伝学一般 , 分子・遺伝情報処理 , 生物科学研究法一般

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