モデル系統発生における長いペンダント端の予測と生物多様性と樹木推定への応用【JST・京大機械翻訳】

Bocharov, S.; Harris, S.; Kominek, E.; Mooers, A. O.; Steel, M.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202208761596955 整理番号：21P0266316

モデル系統発生における長いペンダント端の予測と生物多様性と樹木推定への応用【JST・京大機械翻訳】

Predicting long pendant edges in model phylogenies, with applications to biodiversity and tree inference

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発行年： 2022年04月06日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年04月06日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

AO_SCPLOWBSTRACTC_SCPLOWは,最も単純な系統発生多様化モデル(純産Yuleプロセス)であり,系統は時間tの一定速度{lambda}で独立して分裂する。得られたツリーにおけるランダム選択エッジ(内部またはペンダントのどちらか)の長さは,tが成長するにつれて[Formula]に急速に収束する期待値を持ち,従ってtとは本質的に独立である。しかし,最長のペンダント端の長さLの挙動は著しく異なる挙動を明らかにした:Lは葉の予想数が増加するにつれてt/2に収束する。消光速度(ここで<{lambda})を可能にするこのモデルを拡張するため,t/2がt/2{中間点}(1 ̄-/{lambda})に置換される以外は,出生死木に対する同様の結果も確立した。この完全ツリーは,時間t前に死亡したサブツリーを含むかもしれない。時間tとそれらの直接祖先に存在する葉のみを含む縮小木では,最長のペンダントエッジ長Lは再びt/2に収束する。したがって,関連するペンダント枝が,全クレードの起源に時間内におよそ半分の背に付着する,少なくとも1つの現存する種があるようである。また,最短エッジの長さを簡単に考察した。本結果は生物多様性保存における系統発生多様性指数に関連し,樹木を正確に推論するために必要な配列の長さを定量化する。著者らは,著者らの理論的結果を,すべての哺乳類の最近の系統樹からの分岐長さとシミュレーションと比較した。【JST・京大機械翻訳】

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進化論一般

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