抄録/ポイント：
抄録/ポイント
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【背景】中程度の気候における糖の主要な供給源として,糖生産ビート(Beta vulgaris subsp.vulgaris)は高い経済価値を持っている。しかし,栽培ビート内の低い遺伝的多様性は,例えば作物野生近縁種にしばしば存在する耐性と耐性属性を増加させるために,新しい形質の導入を必要とする。これに対し,野生ビートの遺伝情報とそれらの系統発生配置は,互いに重要である。この必要性に答えるために,Betoidea(Caryophylles目)に埋込まれたビート属BetaとPatellifoliaを横断して,広い種スペクトルから完全なプラストーム配列を配列決定し,組み立てた。次に,この汎プラストデータセットを用いて,高分解能における野生ビート系統発生を決定した。【結果】著者らは,Betoideae亜科の11の種を表す18の近縁系統種のプラストームを配列し,そして,ビート野生近縁種および多様な植物秩序Caryophylalesのさらなる研究のための重要な資源を表す高品質プラストーム集合を提供した。それらの集合サイズは149,723bp(Beta vulgaris subsp.vulgaris)から152,816bp(Beta nana)の範囲であり,遺伝子間配列においてほとんどの変動があった。ミトコンドリア情報に基づく読取に基づく処理によるプラストーム由来系統学を組み合わせて,著者らは調査したBetoideae種の統一的で高信頼の系統発生配置を示唆することができた。結果は,Beta属が2つの明確に分離されたセクションBetaとCorolinaeに分割できることを示した。著者らの分析は,他のCorolinae種によるB.nanaの親和性を確認し,Nanaeセクションにおける別の配置に対する議論を行った。Patellifolia属内では,2つの二倍体種PatellifoliaプロクバンとPatellifolia webbianaは,プラストーム配列に関して,四倍体Patellifolia膝蓋骨より遺伝的に類似していた。それにもかかわらず,すべての3つのPatellifolia種は明らかに分離された。【結論】結論として,著者らの野生ビートプラストーム集合は,ビート生殖質の分子基盤を理解するための新しい資源である。表現型レベルに関する大きな差異にもかかわらず,著者らの汎プラストデータセットは高度に保存されていた。ビートにおいて,著者らの全プラストーム配列は個々の遺伝子における低配列変動を克服し,高度に分解されたビート系統ゲノムに対する分子骨格を提供する。したがって,著者らのプラストーム配列決定戦略は,他の密接に関連した分類群を解明するためにゲノムアプローチをガイドできる。【JST・京大機械翻訳】
