Mycobacterium tuberculosisの現代の系統は西インドで最近導入され,伝達性増加を示す【JST・京大機械翻訳】

Dixit, A.; Kagal, A.; Ektefaie, Y.; Freschi, L.; Karyakarte, R.; Lokhande, R.; Groschel, M. I.; Tornheim, J. A.; Gupte, N.; Pradhan, N. N.; Paradkar, M. S.; Deshmukh, S.; Kadam, D.; Schito, M.; Engelthaler, D. M.; Gupta, A.; Golub, J.; Mave, V.; Farhat, M. R.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202209063895580 整理番号：22P0034057

Mycobacterium tuberculosisの現代の系統は西インドで最近導入され,伝達性増加を示す【JST・京大機械翻訳】

Modern lineages of Mycobacterium tuberculosis were recently introduced in western India and demonstrate increased transmissibility

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資料名：
発行年： 2022年01月05日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年01月05日
JST資料番号： O7002B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

【背景】Mycobacterium tuberculosis(Mtb)伝達性は,系統(または変異体)の間で変化し,これは結核(TB)発生率の遅い低下に寄与する可能性がある。本研究の目的は,インド,プーンの2つのコホート研究の参加者の間で,Mtbの4つの主要系統(L1-4)にわたる伝染性を比較することであった。【方法】Maharashtra,Puneの公共治療センターでの肺TB探索ケアの成人の2つの前向きコホート研究において,参加者からのMtb喀痰培養陽性分離株の全ゲノム配列決定(WGS)を行った。以前に検証されたランダム森林モデルを用いて,第1および第2選択薬に対する遺伝子型感受性予測を行った。著者らは,単一ヌクレオチド置換(SNS)と最尤推定を用いて,系統によって分離株系統を構築した。Bayes分子年代測定を用いて先祖ノード年齢を推定し,2試料Kolmogorov-Smirnov(KS)試験を用いて樹木特性を比較した。結果:WGSを受けた異なる研究参加者からの642分離株のうち,612は配列品質基準を満たした。612人の参加者の年齢中央値は31歳(IQR24.4~44.2)で,大多数は男性(64.7%)と喀痰塗抹陽性(83.3%)で,6.7%はHIVと共感染があった。大部分の分離株はL3(44.6%)に属した。多剤耐性分離株(MDR,イソニアジドおよびリファンピンに耐性)の大多数(61.1%)はL2(P<0.001[Fishers Exact])に属した。4つの主要系統に感染した参加者間で宿主特性に有意差は認められなかった。系統発生解析では,L1およびL3樹木と比較して,L2樹におけるより短い末端枝長を測定し,透過とサンプリングの間,およびより高い伝達性(中央値枝長:L2~3.3,L3~7.8,p<0.001)の間のより少ない時間消去を示した。L2とL4の分岐時間はL1とL3より最近であり,領域への最近の導入を示した(p<0.01[KS試験])。【結語】現代のMtb系統(L2およびL4)は,より最近,より古い系統(L1およびL3)と比較して,西部インドにおいて導入した。L2は薬剤耐性のより高い頻度とより高い伝達性を示す。著者らの知見は,L2によるTBの症例周辺の接触追跡の必要性を強調し,インドにおけるTB抗生物質耐性の高度化サーベイランスを浮き彫りにした。【JST・京大機械翻訳】

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感染症・寄生虫症一般 , 抗細菌薬の基礎研究

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