二分脊椎の胎児由来の羊膜細胞における新規栄養素感受性遺伝子調節ネットワークの同定【JST・京大機械翻訳】

White, M.; Arif-Pardy, J.; Connor, K. L.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202209117328571 整理番号：22P0326620

二分脊椎の胎児由来の羊膜細胞における新規栄養素感受性遺伝子調節ネットワークの同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of novel nutrient-sensitive gene regulatory networks in amniocytes from fetuses with spina bifida

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発行年： 2022年12月14日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年12月14日
JST資料番号： O7002B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

神経管欠損(NTDs)は,最も一般的な先天性異常の中で残っている。しかし,危険因子は遺伝学と栄養欠乏を含むが,NTDにおける栄養-遺伝子相互作用の包括的評価は不足している。NTDs(症例;n=3)と先天性異常のない胎児(対照;n=5)の胎児からの羊膜細胞遺伝子発現データ(GSE4182)における栄養感受性遺伝子調節ネットワークを同定するために,栄養焦点遺伝子発現分析パイプラインを適用した。差次的発現遺伝子(DEG)を栄養補因子を持つためにスクリーニングした。DEGを調節する栄養依存性転写調節因子(TR)とNTDとの以前のリンクを持つ栄養感受性miRNAを同定した。880のDEGのうち,10%は少なくとも1つの栄養素補因子を有した。DEG調節ネットワーク分析は,症例におけるDEGの39%と52%が,それぞれ22の栄養感受性miRNAと10の栄養依存性TRによって調節されることを明らかにした。亜鉛とBのビタミン依存性遺伝子調節ネットワーク(Zinc:DEGの50.6%を標的化する10のTR,Bビタミン:DEGの37.7%を標的化する4つのTR,DEGの17.6%を目標とする9つのmiRNAs)は,症例において調節不全であった。著者らは以前にNTDにリンクしていない新規,栄養感受性遺伝子調節ネットワークを同定し,NTD予防または胎児発育の最適化のための新たな標的を示すかもしれない。【JST・京大機械翻訳】

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遺伝子発現

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