マウス前立腺における葉と歪による上皮と間質細胞の不均一性の単一細胞アトラス【JST・京大機械翻訳】

Graham, M. K.; Chikarmane, R.; Wang, R.; Vaghasia, A. M.; Gupta, A.; Zheng, Q.; Wodu, B. P.; Pan, X.; Castagna, N.; Liu, J.; Meyers, J.; Skaist, A.; Wheelan, S. J.; Simons, B. W.; Bieberich, C.; Nelson, W.; DeWeese, T. L.; De Marzo, A. M.; Yegnasubramanian, S.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202209118400306 整理番号：22P0313928

マウス前立腺における葉と歪による上皮と間質細胞の不均一性の単一細胞アトラス【JST・京大機械翻訳】

Single-cell atlas of epithelial and stromal cell heterogeneity by lobe and strain in the mouse prostate

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発行年： 2022年01月31日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年01月31日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

組織微小環境における細胞型の複雑な相互作用を評価することは,前立腺における疾患の起源と進行および介入に対する潜在的機会を理解するために重要である。マウスモデルは,生物レベルでの前立腺疾患の分子的および細胞型特異的寄与を研究するための必須のツールである。各マウス株内の異なるマウス株と前立腺葉における種々の遺伝子操作マウスモデルにおける疾患発生の程度,タイミング,および性質に,よく報告されている差異があるが,マウス株および前立腺葉にわたる細胞型における根底にある分子表現型の違いは,不完全に理解されている。これに対処するために,2つの一般的に使用されるマウス株FVB/NJとC57BL/6Jから個々のマウス前立腺葉の単一細胞トランスクリプトームを調べた。データ次元縮小とクラスタ分析は,基底と内腔細胞が,顕著な葉特異的差異を示す内腔細胞と共に,菌株特異的トランスクリプトーム差異を有することを明らかにした。さらに,上皮細胞の3つの希少集団は,株と葉から独立してクラスタ化された:Foxi1を発現する管腔細胞の1つの集団と液胞ATPアーゼプロトンポンプ(Atp6v0d2とAtp6v1g3)の成分,Pscaと他の幹細胞関連遺伝子(Ly6a/Sca-1,Tacstd2/Trop-2)を発現する他の集団,およびChga,ChgbとSypを発現する神経内分泌個体群。対照的に,線維芽細胞,平滑筋細胞,内皮細胞,周皮細胞,および免疫細胞型を含む間質細胞クラスターは,株および葉を通して保存され,主に細胞型によりクラスタ化され,株または葉によってはされなかった。1つの注目すべき例外は,マウス前立腺におけるそれらの著しく異なる空間分布に基づいて,サブグランド線維芽細胞および間質線維芽細胞を満期する2つの異なる線維芽細胞集団の同定であった。まとめると,これらのデータは,2つの一般的に使用されるマウス株および4つの前立腺全葉を通してマウス前立腺の転写プロファイルの実際的参照を提供する。【JST・京大機械翻訳】

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生殖器官 , 基礎腫よう学一般 , 細胞生理一般 , 腫ようの化学・生化学・病理学

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