背側および腹側線条体におけるアルコール使用障害のマルチオミクスシグネチャー【JST・京大機械翻訳】

Zillich, L.; Poisel, E.; Frank, J.; Foo, J. C.; Friske, M. M.; Streit, F.; Sirignano, L.; Heilmann-Heimbach, S.; Heimbach, A.; Hoffmann, P.; Degenhardt, F.; Hansson, A. C.; Bakalkin, G.; Noethen, M. M.; Rietschel, M.; Spanagel, R.; Witt, S. H.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202209129166534 整理番号：21P0285146

背側および腹側線条体におけるアルコール使用障害のマルチオミクスシグネチャー【JST・京大機械翻訳】

Multi-Omics Signatures of Alcohol Use Disorder in the Dorsal and Ventral Striatum

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資料名：
発行年： 2022年04月05日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年04月05日
JST資料番号： O7002B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

アルコール使用障害(AUD)は,世界的な死亡率と罹患率に対する主要な貢献者である。死後ヒト脳組織は,中毒の神経回路におけるAUDの分子機構の研究を可能にする。AUDと対照の個体間の腹側および背側線条体における差次的発現(DE)遺伝子を同定し,その結果をゲノムおよびエピゲノムワイド関連研究(GWAS/EWAS)の知見と統合し,AUDの機能的関連分子機構を同定した。DNAメチル化および遺伝子発現(RNA-seq)データは,AUDを有する48人の個人の死後脳サンプルおよび腹側線条体(VS)および背側線条体領域尾状核(CN)および被殻(PUT)からの51人の対照から発生した。DESeq2を用いてDE遺伝子を同定し,遺伝子セット濃縮分析(GSEA)を行い,MAGMAを用いたGWASの結果におけるDE遺伝子の濃縮を試験した。加重相関ネットワーク分析(WGCNA)をDNAメチル化のために実施し,遺伝子発現データと遺伝子重複を試験した。背側線条体において,著者らは合計50の遺伝子に対して差次的発現(FDR<0.05)を発見した。VSでは,FDR<0.25のDE遺伝子は,問題のあるアルコール使用の最近のGWASで過剰発現した。ARHGEF15遺伝子は3つの脳領域でアップレギュレートされた。CNとVSのGSEAは,細胞-構造関連GO-項と免疫経路に対するPUTを示した。AUDと最も強く関連するWGCNAモジュールは,免疫応答と炎症経路に強い濃縮を示した。マルチオミクスデータセットの統合分析は,AUDにおける免疫および炎症関連プロセスの重要性に対する更なる証拠を提供した。【JST・京大機械翻訳】

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中枢神経系

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