FastCATは複数の短い非精製キメラ標準を用いた蛋白質の絶対定量を加速する【JST・京大機械翻訳】

Rzagalinski, I.; Bogdanova, A.; Raghuraman, B. K.; Geertsma, E. R.; Hersemann, L.; Ziemssen, T.; Shevchenko, A.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202209158053838 整理番号：22P0031204

FastCATは複数の短い非精製キメラ標準を用いた蛋白質の絶対定量を加速する【JST・京大機械翻訳】

FastCAT accelerates absolute quantification of proteins by using multiple short non-purified chimeric standards

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発行年： 2022年04月19日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年04月19日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

蛋白質の絶対(モル)定量は,多様な分子機構のシステムレベルモデリングの分析的根拠を提供する。FastCAT法は,定量された蛋白質を表す連結型量子化型(Q-)ペプチドからなる多重短(<50kDa)安定同位体標識キメラ蛋白質(CPs)を用いる。各CPは,その存在量を単一蛋白質標準(BSA)と関係づける参照(R-)ペプチドのスクランブル配列も含む。高速CATはCPを精製するかSDS-PAGEを用いる必要性を軽減するだけでなく,標的蛋白質の期待した存在量に従ってQ-ペプチドをグループ化することにより,絶対定量の精度,精度およびダイナミックレンジを改善する。MS Westernの参照法に対してFastCATをベンチマークし,低ng/mLレベルのヒト脳脊髄液中の神経マーカーの直接モル定量において試験した。【JST・京大機械翻訳】

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蛋白質・ペプチド一般

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