Hadza Hunter-Gatherersの超深度配列決定は消失する微生物を回収する【JST・京大機械翻訳】

Merrill, B. D.; Carter, M. M.; Olm, M. R.; Dahan, D.; Tripathi, S.; Spencer, S. P.; Yu, F. B.; Jain, S.; Neff, N.; Jha, A. R.; Sonnenburg, E. D.; Sonnenburg, J. L.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202209160866323 整理番号：22P0326090

Hadza Hunter-Gatherersの超深度配列決定は消失する微生物を回収する【JST・京大機械翻訳】

Ultra-deep Sequencing of Hadza Hunter-Gatherers Recovers Vanishing Microbes

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発行年： 2022年10月07日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年10月07日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

腸ミクロビオームは,免疫および代謝健康の重要な調節因子である。ヒトのミクロビオームデータは工業化された個体群に偏っており,明確で多様な非工業化ミクロビオームの限られた理解を提供する。ここでは,タンザニアのHadza,ハンター-ガザー,およびネパールとCaliforniaにおける比較個体群からの351の糞便サンプルについて,超深部メタゲノム配列決定と菌株培養を行った。細菌,古細菌,バクテリオファージおよび真核生物の94971の全ゲノムを回収し,その内の43%は既存の統一データセットから存在しなかった。in situ増殖速度,遺伝的pN/pSシグネチャ,高分解能菌株追跡,および工業化集団で消滅する124の腸-常在種の分析は,Hadza腸ミクロビオームの分化動力学を明らかにした。産業化された腸内微生物は,おそらく炎症過程へのミクロビオーム適応の結果,酸化ストレスに関連する遺伝子に富む。Hadza腸ミクロビオームのこの非平行見解は,ヒト腸をコロニー形成できる微生物の理解を拡大し,工業化したライフスタイルによりもたらされる広範な摂動を明らかにする貴重な資源を提供する。【JST・京大機械翻訳】

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, 【Automatic Indexing@JST】

微生物の生態 , 遺伝学研究法

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