抄録/ポイント：
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冠状動脈性虚血性イベントの発生および進行の背景的同定は,腫瘍を合併した冠動脈心疾患の診断および治療にとって特に重要である。このため,最初の心筋梗塞後の再発心筋梗塞のバイオマーカーと調節因子を解析することは非常に重要である。腫瘍発生と転移および臨床生存効果に関する冠状動脈性心疾患または心筋梗塞の調節因子を指定するために,心筋梗塞,マイクロアレイデータセット,データセットの総合評価が重要なカット遺伝子および癌,腫瘍予後,腫瘍が突然変異の免疫レベルに拡大しているので,GEOデータベースから選択する。本研究の目的は,癌における心筋梗塞調節因子の役割を発見することである。【方法】GSE48060チップデータセットをGEOデータベースからダウンロードし,正常心臓機能制御からの血液サンプルの遺伝子発現プロファイルと最初の心筋梗塞後48時間以内の最初のAMI患者を得た。GEO2RオンラインツールとExcelソフトウェアを,再梗塞試料とGSE48060チップデータセットの正常サンプルの間の差動遺伝子をスクリーニングするために使用した。DAVIDデータベースをDEGのGOとKEGGの濃縮分析に用いた。PPIネットワークを構築し,STRINGデータベースとサイトスケープソフトウェアを用いて可視化し,キー遺伝子をサイトスコープソフトウェアのCytoHubbaプラグインによりスクリーニングした。TIMERデータベースとGEPIA2ウェブサイトを用いて,全身癌における腫瘍組織と正常組織の間の主要遺伝子の発現レベルを分析し,検証した。GEPIA2ウェブサイトを用いて,鍵遺伝子と腫瘍予後の間の相関を分析した。鍵となる遺伝子発現と腫瘍純度と各免疫細胞の間の相関を,TIMERデータベースによって分析した。CBioPortalウェブサイトを用いて,腫瘍における主要遺伝子の突然変異と相関を分析した。【結果】分析を通して,再梗塞サンプルと正常サンプルの17のGSE48060チップデータセットの差異遺伝子を得て,上記の遺伝子は,すべて下方制御された遺伝子であった。PPIネットワークを構築することを通して5つの重要遺伝子を得て,それはGART,SOD2,KLRF1,ERAP2およびCXCL5をTIMER結果に記録し,BLCA,BRCA,CHOL,COAD,ESCA,HNSC,KICH,KIRC,LHC,LUAD,LUSC,PRAD,READ,STADおよびTHCAにおけるGARTの発現レベルは,正常組織におけるそれと有意に異なった(P<0.001)。BRCA,ESCA,KICH,KIRC,KIRP,LUSC,SKCMおよびSTADにおけるSOD2の発現レベルは,正常組織と有意に異なった(P<0.001)。BRCA,COAD,HNSC,LIHC,LUAD,LUSC,PRAD,READ,STADおよびUCECにおけるKLRF1の発現レベルは,正常組織におけるそれらと有意に異なった(P<0.001)。BRCA,KIRCおよびLUSCにおけるERAP2の発現レベルは,正常組織におけるそれらと有意に異なった(P<0.001)。BRCA,COAD,ESCA,HNSC,KICH,KIRC,KIRP,LUAD,LUSC,PRAD,STAD,THCAおよびUCECにおけるCXCL5の発現レベルは,正常組織におけるそれらと有意に異なった(P<0.001)。GEPIA2の結果は,CESC,CHOL,ESCA,KICH,LUSC,SARCおよびSTADにおけるGARTの発現レベルが腫瘍組織と正常組織の間に有意差を示した(P<0.05)。腫瘍組織と正常組織との間のBLCA,BRCA,ESCA,PAADおよびPCPGにおけるSOD2の発現レベルに有意差があり(P<0.05),腫瘍組織と正常組織との間のLUADおよびLUSCにおけるKLRF1の発現レベルに有意差がみられた(P<0.05)。KICHとLUSC(P<0.05)における腫瘍組織と正常組織の間のERAP2発現における有意差があり,CHOL,COAD,ESCA,LUAD,LUSC,READとSTADにおける腫瘍組織と正常組織の間のCXCL5発現において有意差があった(P<0.05)。腫瘍生存分析の結果は,GARTとCESC,KIRC,LUAD,READ,およびSARCの全体的腫瘍生存率(OS)の間の相関が統計的に有意であることを示した(P<0.05)。SKCMのSOD2とTUMOR OSの間の相関は統計的に有意であった(P<0.05)。KLRF1とHNSCの間のTUMOROSの相関は統計的に有意だった(P<0.05)。KICHとKIRCのCXCL5とTUMOROSの間の相関は,統計的に有意であった(P<0.05)。GARTとLUADs腫瘍ステージ(P<0.05),SOD2とSKCMs腫瘍ステージ(P<0.05),CXCL5とKICHとKIRCs腫瘍ステージの間に統計的に有意な相関があった(P<0.05)。GART遺伝子発現レベルは,CESC,KIRC,LUAD,READおよびSARCにおける種々の免疫細胞と有意に相関していた。SOD2遺伝子の発現レベルはSKCMにおける種々の免疫細胞と有意に相関していた。KLRF1遺伝子の発現レベルは,HNSCにおける種々の免疫細胞と有意に相関していた。CXCL5遺伝子の発現レベルは,KICHおよびKIRCにおける種々の免疫細胞と有意に相関していた。COAD,KICH,LIHC,READ,SKCMおよびTHCAにおける突然変異の比率は最も高く,BRCA,ESCA,HNSC,KIRC,LUSCおよびSTADにおける増幅の比率は最も高く,LUADおよびPRADにおける重度の欠失の比率は最も高かった。結論:初期の心筋梗塞の後の再発性心筋梗塞の鍵となる下方制御された遺伝子は,腫瘍発生,転移,臨床生存および免疫浸潤に関連がある。再発性心筋梗塞における主要ダウンレギュレーション遺伝子は,癌の診断および治療のための重要なバイオマーカーとして役立つ可能性がある。【JST・京大機械翻訳】
