臨床血漿サンプルからのマイクロRNA-seqにおける溶血検出【JST・京大機械翻訳】

Smith, M. D.; Leemaqz, S. Y.; Jankovic-Karasoulos, T.; McAninch, D.; McCullough, D.; Breen, J.; Roberts, C. T.; Pillman, K. A.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202209256896630 整理番号：22P0326564

臨床血漿サンプルからのマイクロRNA-seqにおける溶血検出【JST・京大機械翻訳】

Haemolysis detection in microRNA-seq from clinical plasma samples

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発行年： 2022年04月04日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年04月04日
JST資料番号： O7002B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

無細胞マイクロRNA(miRNA)の豊度は,いくつかの疾患に対する新規で最小侵襲性のバイオマーカーポテンシャルを有するソースとして提案されている,血漿を含む多くの体液中で測定される。血漿miRNAの定量方法の改善にもかかわらず,最適参照miRNAに関するコンセンサスはなく,また,溶血が血漿miRNA含量に影響を及ぼす可能性がある。ここでは,ヒト血漿を用いて調製されたライブラリーからのmiRNAハイスループット配列決定(HTS)データにおける溶血を検出する新しい方法を提案した。血漿におけるmiRNA溶血シグネチャを確立するために,著者らは最初に既知の溶血状態を有するサンプルと,著者らの溶血群における統計的に有意なより高い豊度を有する選択されたmiRNAの間の差次的に発現したmiRNAを同定した。署名miRNAの差次的存在量に対する技術的および生物学的理由の両方があり,ここで開発した方法を,生殖年齢の女性である著者らの特定の文脈の外で,妊娠と非妊娠群の間の有意差を試験した。ここでは,新しい20のmiRNAシグネチャ(miR-106b-3p,miR-140-3p,miR-142-5p,miR-532-5p,miR-17-5p,miR-19b-3p,miR-30c-5p,miR-324-5p,miR-183-5p,miR-451a,miR-182-5p,miR-425-5p,miR-182-5p,miR-451a,miR-182-5p,miR-191-5p,miR-194-5p,miR-20b-5p,miR-194-5p,miR-182-5p,miR-191-5p,miR-194-5p,miR-19溶血性汚染の可能性を考えると,溶血検出のアッセイが標準予備分析実践となり,溶血検出の簡単な方法を提供する。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , 【Automatic Indexing@JST】

腫ようの診断 , 核酸一般 , 遺伝子発現

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