古代単純ヘルペス1ゲノムはユーラシアにおける最近のウイルス構造を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Guellil, M.; van Dorp, L.; Inksip, S. A.; Dittmar, J. M.; Saag, L.; Tambets, K.; Hui, R.; Rose, A.; D'Atanasio, E.; Kriiska, A.; Varul, L.; Koekkelkoren, A. M. H. C.; Goldina, R. D.; Cessford, C.; Solnik, A.; Metspalu, M.; Krause, J.; Herbig, A.; Robb, J. E.; Houldcroft, C.; Scheib, C. L.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202209453462936 整理番号：22P0312784

古代単純ヘルペス1ゲノムはユーラシアにおける最近のウイルス構造を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Ancient herpes simplex 1 genomes reveal recent viral structure in Eurasia

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発行年： 2022年01月21日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年01月21日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

ヒト単純ヘルペスウイルス1(HSV-1)は,経口接触により伝播する生命長感染であり,今日,成人の大多数に感染するが,古代のHSV-1ゲノムはまだ公表されていない。ヨーロッパ,汎ヨーロッパ,アフリカのグループ2,3にサンプリングした多様性の地理的クラスタ化は,より若い起源が提案されたが,アフリカ4から移動している解剖学的に現代的なヒトと共発散するウイルスが提案されたことを示唆する。古代HSV-1ゲノムの欠如,組換の高率,および現代時代におけるヒトの高い移動性は,HSV-1sの進化史の理解を妨げてきた。ここでは,3つの完全な古代ヨーロッパHSV-1ゲノムと1つの部分的ゲノム,10.16xまでの対ヒトゲノムで9.5xまで配列決定された3世紀と17世紀のCEの間を年代測定する。これらのHSV-1株は現代のユーラシア多様性内に入る。4.68(3.87~5.65)kyaにサンプリングされた現代のユーラシア多様性の推定年代をもたらす非African多様性に対する7.6x10 ̄-7-1.13x10 ̄-6の平均突然変異率を推定した。これらの速度の外挿は,サンプリングしたHSV-1から5.29(4.60-6.12kya)の年代を示し,これは,ユーラシアによるHSV-1の分布において,後期新石化とBronzeの年代移動6を暗示する系統置換を示唆する。【JST・京大機械翻訳】

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ウイルス感染の生理と病原性

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