Alzheimer病素因を理解するための統合ゲノムとフェノームワイド関連研究アプローチ【JST・京大機械翻訳】

Khaire, A.; Wimberly, C. E.; Semmes, E. C.; Hurst, J. H.; Walsh, K. M.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202209501233782 整理番号：22P0034041

Alzheimer病素因を理解するための統合ゲノムとフェノームワイド関連研究アプローチ【JST・京大機械翻訳】

An integrated genome and phenome-wide association study approach to understanding Alzheimer's disease predisposition

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発行年： 2022年01月05日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年01月05日
JST資料番号： O7002B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

背景:ゲノムワイド関連研究(GWAS)は,遅発性Alzheimer病(LOAD)リスクを増加させる一般的で遺伝性の対立遺伝子を同定した。著者らは最近,GWASとフェノームワイド関連研究(PheWAS)データを統合するための解析的アプローチを発表し,疾患リスクに影響する候補形質と形質関連変異体の同定を可能にし,ここではLOADに適用した。方法:PheWASは,UK Biobankデータを用いて23の既知のLOAD関連一塩基多型(SNP)と4:1のマッチした対照SNPに対して行われた。LOAD SNPとの会合を多く含む形質を確認し,LOADリスクとの関連で試験する形質関連候補SNPの同定に用いた(170,008例;37,154対照)。【結果】LOAD関連SNPは,3つの血小板形質を含む6/778の質問形質との関連のために,有意に豊かであった。最強の濃縮は血小板分布幅(PDW)(P=1.2x10 ̄-5)であったが,変異体またはメンデルのランダム化分析におけるPDWとLOAD感受性の増加の間には,効果の一貫した方向は観察されなかった。事前GWASにより同定された384のPDW関連SNPのうち,36はLOADリスクと名目上関連し,5つは多重試験に対する偽発見率補正を生存した。関連は,PICALM,CD2AP,SPI1およびNDUFAF6の近くの既知のLOADリスク遺伝子座を確認し,上皮成長因子受容体(EGFR)遺伝子における新規リスク遺伝子座を同定した。結論:GWASとPheWASデータの統合により,LOADの遺伝的決定因子と血小板形態の間の実質的なple食性を同定し,初めて,Alzheimer病感受性における{β}アミロイド毒性のメディエーターであるEGFR-aの介在性を同定した。【JST・京大機械翻訳】

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遺伝的変異

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