単一細胞状態の系統的,蛋白質活性に基づく特性化【JST・京大機械翻訳】

Vlahos, L. J.; Obradovic, A.; Worley, J.; Tan, X.; Howe, A.; Laise, P.; Wang, A.-L.; Drake, C. G.; Califano, A.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202209522486729 整理番号：21P0255242

単一細胞状態の系統的,蛋白質活性に基づく特性化【JST・京大機械翻訳】

Systematic, Protein Activity-based Characterization of Single Cell State

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発行年： 2023年01月10日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2023年01月10日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

単細胞RNA配列決定は,病態生理学的組織生物学と不均一性に関して顕著なウィンドウを提供するが,その高い遺伝子ドロップアウト率と低いSN比は,定量的分析と機構的理解に挑戦する。この問題に取り組むために,哺乳類組織のネットワークベースの単一細胞分析のためのプラットフォームであるPISCESを開発した。PISCESは,それらの系統特異的転写標的の発現に基づき,細胞状態実装および維持に対する調節およびシグナル伝達蛋白質の機構的寄与を正確に推定し,従って,細胞状態および細胞状態遷移のMaster調節因子の発見および可視化を支持する。抗体とCITE-Seqに基づく測定値との一致の評価を含む実験的検証アッセイは,遺伝子発現解析と比較して,稀な亜集団を同定し,重要な系統マーカーを解明する能力の顕著な改善を示した。ヒト蛋白質Atlas(HPA)における単一細胞プロファイルの系統的分析は,ヒト組織研究のための包括的資源を生成し,異なる細胞状態,分子決定因子および表面マーカーの微細粒層化を支持した。【JST・京大機械翻訳】

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, , 【Automatic Indexing@JST】

遺伝子発現

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