抄録/ポイント：
抄録/ポイント
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Saccharobacteria Nanosynbacter lyticus TM7xは広く分布したCandidate Phylum放射線のメンバーである。これらの細菌は,他の細菌の表面上のエピビオントとして,超小型細胞サイズ,減少したゲノム,および生きた。この関係を確立し維持する機構はまだ完全には理解されていない。エピビオントTM7xとその宿主細菌Schaalia odontolyticus株XH001のトランスクリプトームを,初期相互作用と安定共生の両方の間の共生の確立を通して捕捉した。結果は,初期遭遇と安定共生,特に輸送体遺伝子間の両種の遺伝子発現の大きなシフトと動的相互作用を示した。安定な共生の間,宿主XH001はペプチドグリカン生合成,マンノシル化,細胞周期およびストレス関連遺伝子に対するより高い遺伝子発現を示したが,染色体分配遺伝子の発現は低かった。これはTM7xに感染したXH001で見られる伸長した細胞形状と一致し,感染が細胞壁を厚くすることを発見した。TM7x内で,安定共生中のpili,IV型エフェクター遺伝子,アルギニン異化/生合成遺伝子発現は,相互作用におけるこれらの機能に重要な役割を暗示した。de novo生合成能の低下を伴う偏性エピビオントとしてのヒトミクロビオームにおける生存と持続性と一致して,TM7xはまた,エネルギー生産とペプチドグリカン生合成に対してより高いレベルを示したが,安定共生の間,ストレス関連遺伝子のより低い発現を示した。これらの結果は,TM7xとその宿主細菌が,エピ共生生活様式を維持するための微妙なバランスを維持することを意味する。IMPORTANCANanosynbacter lytolyticus型株TM7xは,SaccharibacteriumとCandidate Phyla放射線(CPR)の最初の栽培メンバーである。宿主細菌と偏性エピバイオティクス関係を確立する高度に減少したゲノムを持つ超小細胞サイズを持つことを見出した。CPRは,現在,Patecibacteria super-phylumとして形式的に提唱され,Saccharibacteriaを含むゲノム減少を伴う多様な細菌の大きな単系統放射線である。CPRの大多数は実験室においてまだ栽培されておらず,今日までこれらのユニークな生物への我々の洞察は少数のSaccharobacteria種に由来する。しかし,多くのde novo生合成経路を欠いているこれらの小さな偏性寄生性Saccharibacteriaは,環境と同様にヒトミクロビオーム内の高い罹患率で維持される。TM7xがその宿主細菌に感染すると,初期相互作用,死滅相,回復相,および最終的に安定な共生を含む,異なる時間的相が存在する。ここでは,これらのユニークな微生物が生存し,持続するかの機構への最初の洞察を示す,この動的相互作用中の宿主細菌とエピビオントの遺伝子発現を捉えた。【JST・京大機械翻訳】
