PeroxiHUB:シグナルインテグレータとしてH_2O_2を用いたモジュラー無細胞バイオセンシングプラットフォーム【JST・京大機械翻訳】

Soudier, P.; Duigou, T.; Voyvodic, P. L.; Zuniga, A.; Bazi-Kabbaj, K.; Kushwaha, M.; Bonnet, J.; Faulon, J.-L.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202209806398030 整理番号：22P0318393

PeroxiHUB:シグナルインテグレータとしてH_2O_2を用いたモジュラー無細胞バイオセンシングプラットフォーム【JST・京大機械翻訳】

PeroxiHUB: a modular cell-free biosensing platform using H2O2 as signal integrator

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発行年： 2022年03月16日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月16日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

無細胞システムは,ロバストで,安価で,フィールド展開可能なバイオセンサを送達する大きな可能性を有する。多くの無細胞バイオセンサーは小分子に応答する転写因子に依存するが,それらの発見と実行はなお困難である。ここでは,異なる代謝産物の無細胞検出を支持する最適化H_2O_2中心センシングプラットフォームであるPeroxiHUBのエンジニアリングを報告する。H_2O_2は中心代謝産物であり,多くの酵素反応の副産物である。ペルオキシHUBは酵素変換器を用いてH_2O_2に興味のある代謝産物を変換し,代替トランスデューサを用いたセンサ特異性の迅速な再プログラミングを可能にする。最初に,いくつかの転写因子をスクリーニングし,無細胞におけるH_2O_2に対する転写応答に対するOxyRを最適化し,適切なシグナル対ノイズ比を得るためのプレインキュベーション段階の必要性を強調した。次に,SynBioCAD Galaxyポータルで利用可能なカスタムレトロ合成ワークフローを介して,異なるトランスデューサをマイニングする,臨床上の興味のある乳酸,サルコシンおよびコリンの代謝物のモジュール検出を示した。プレインキュベーション段階中の変換器の表現が最適センサ操作に重要であることを見出した。最後に,異なるレポーターがPeroxiHUBに接続され,様々な応用に対して高い適応性を提供することを示した。H_2O_2を生成する広範囲の酵素反応を考えると,PeroxiHUBプラットフォームは,モジュールおよびスケーラブルな様式で多数の代謝産物の無細胞検出を支援するであろう。【JST・京大機械翻訳】

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細胞生理一般 , 微生物代謝産物の生産

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