深海堆積物からのThaumarchaeotaのゲノムは独立に進化した3系統の特異的適応を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Kerou, M.; Ponce-Toledo, R. I.; Zhao, R.; Abby, S. S.; Hirai, M.; Nomaki, H.; Takaki, Y.; Nunoura, T.; Jorgensen, S. L.; Schleper, C.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202209897380774 整理番号：22P0239675

深海堆積物からのThaumarchaeotaのゲノムは独立に進化した3系統の特異的適応を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Genomes of Thaumarchaeota from deep sea sediments reveal specific adaptations of three independently evolved lineages

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発行年： 2020年06月24日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年06月24日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

※このプレプリント論文は学術誌に掲載済みです。なお、学術誌掲載の際には一部内容が変更されている可能性があります。

海洋堆積物は複雑なミクロビオームに対する広大な生息場所を代表する。これらの中で,Thaumarchaeota門のアンモニア酸化古細菌(AOA)は,最も普通であるが,ほとんど調査されていない住民の1つであり,これは,地下生物圏の厳しい条件に,通常よく適応しているようである。大西洋中~海嶺の山腹と太平洋の浅海平野から得た堆積物コアから最も豊富なAOAクレードの11のメタゲノム集合ゲノムを提示した。それらの系統ゲノム配置は,Caの順序で3つの独立して進化したクレードを明らかにした。培養代表が知られていないNitrosopumilesは,まだ知られていない。他のAOAから知られているアンモニア酸化と炭素固定のための遺伝子セットに加えて,すべてのゲノムは,おそらく蛋白質維持またはアンモニア源としてのアミノ酸の取り込みと同様に,中心炭素代謝にチャンネルされる発酵産物の転換のための拡張能力をコード化する。2つの系統は付加的(V型)ATPアーゼと遺伝子修復システムの大きなレパートリーをコードし,高い静水圧の課題を克服する可能性がある。著者らは,海洋堆積物へのAOAの適応放射が進化において一度以上発生し,この極めてエネルギー制限と高圧環境に対する特定の適応を有する3つの明確な系統をもたらしたことを示唆する。【JST・京大機械翻訳】

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微生物の生態

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