抄録/ポイント：
抄録/ポイント
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CRESS-DNAウイルスは,ほとんど全ての真核生物の木で検出されるユビキタスウイルスであり,地球の生態系維持に必須の役割を果たす。それでも,それらの遺伝的多様性は完全には理解されていない。ここでは,CRESS-DNAウイルスの複製(Rep)とCapsid(Cap)蛋白質の遺伝的多様性を光に光を当てる。CRESS-DNAウイルスのRep蛋白質をCLANSと系統発生解析を用いて10クラスターに分けた。また,Repクラスタ1(R1)とR2(Circoviridae,Smacoviridae,Nanoviridae,およびCRESSV1-5)におけるRep蛋白質の大部分は,Viral_RepスーパーファミリーとP-ループ_NTPアーゼスーパーファミリードメインを含み,一方,他のクラスターのウイルスのRep蛋白質はそのような特性化機能ドメインを有しなかった。また,他のクラスタにおけるウイルスのRep蛋白質は,そのような特徴のない機能ドメインを持たない。。”R1とR2(Circoviridae,Smacoviridae,Nanoviridae,およびCRESSV1-5)は,Viral_RepスーパーファミリーとP-ループ_NTPアーゼスーパーファミリードメインを含む。Circoviridae,NanoviridaeおよびCRESSV1-3ウイルスは,Viral_RepおよびP-ループ_NTPアーゼのような2つのドメインを含む;CRESSV4とCRESSV5ウイルスはViral_Repドメインのみを持ち,pCRESS関連群のほとんどの配列はP-ループ_NTPアーゼのみを持ち,Smacoviridaeはこれら2つのドメインを持たない。さらに,CRESS-DNAウイルスのCap蛋白質をCLANSと系統発生解析を用いて20クラスターに分けた。CircoviridaeとSmacoviridaeのRepとCap蛋白質は特異的クラスターにグループ分けされる。CRESS-DNAウイルスのCap蛋白質は,1つのクラスタともう1つのクラスタを有するRep蛋白質によってグループ化された。さらに,著者らの研究は,選択圧が変異圧力よりむしろCRESS-DNAウイルスRepとCap遺伝子の進化において重要な役割を果たすことを明らかにした。今後,より多くの配列が発見されるので,CRESS-DNAウイルスの遺伝的多様性の決定を助けることが期待される。CRESS-DNAウイルスの遺伝的多様性は,完全には理解されていない。CRESS-DNAウイルスはRep蛋白質のみを用いてCRESSV1とCRESSV6に分類される。CRESS-DNAウイルスのRep蛋白質は,Viral_RepとP-ループ_NTPアーゼドメイン構成,CLANS,および系統発生解析により,CRESSV1とCRESSV6群,および新しいSmacoviridae関連,CRESSV2関連pCRESS関連,Circoviridae関連,および1から4群に分類された。さらに,本研究で初めて,CRESS-DNAウイルスのCap蛋白質をCLANSと系統発生解析により20の異なるクラスターに分類した。この分類を通して,CRESS-DNAウイルスの遺伝的多様性はCapおよびRep蛋白質における組換えの可能性を明らかにした。最後に,選択圧がCapとRep蛋白質の進化と遺伝的多様性に重要な役割を果たすことを示した。本研究は,CRESS-DNAウイルスの遺伝的多様性を説明し,将来の検出ウイルスの分類を助けることを期待する。【JST・京大機械翻訳】
