幹細胞由来膵島のクロマチンと転写景観の定義【JST・京大機械翻訳】

Augsornworawat, P.; Hogrebe, N. J.; Ishahak, M.; Marquez, E.; Maestas, M. M.; Schmidt, M. D.; Veronese-Paniagua, D. A.; Gale, S. E.; Miller, J. R.; Velazco-Cruz, L.; Millman, J. R.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202210160198680 整理番号：22P0316530

幹細胞由来膵島のクロマチンと転写景観の定義【JST・京大機械翻訳】

Defining the chromatin and transcriptional landscape of stem cell-derived islets

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発行年： 2022年09月20日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年09月20日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

ヒト多能性幹細胞から分化したインスリン分泌{β}細胞の移植は,インシュリン依存性糖尿病を治療するための細胞療法として大きな可能性がある。これらの幹細胞由来膵島(SC-islet)は動物モデルで糖尿病を逆転できるが,それらはin vivo対応物と完全には等価ではない。これらのSC-islet内で生成された細胞型の状態をより良く定義し,系統仕様における欠損を同定するための資源を提供するため,単一細胞多染色体配列決定を用いて,初代ヒト膵島と同様に複数の時点でのSC-isletのクロマチンアクセシビリティと転写プロファイルを同時に測定した。各細胞に対する転写およびクロマチン景観の統合分析は,細胞同一性を定義するためのより大きな分解能を提供し,各島細胞タイプを同定するための新しい遺伝子リストを導くことを可能にした。さらに,この多染色体分析は,in vitro分化からの主要なオフターゲットであるSC-{β}細胞とエンテロクロマフィン様細胞間の差が,恒等性における恒星差よりむしろ進行性細胞状態の勾配であることを明らかにした。初代ヒト膵島のクロマチン景観ははるかに制限され,幹細胞由来細胞がそれらの細胞運命に完全には固定されないことを示唆した。in vitroおよびin vivoでのSC-isletの長期間培養は,全体的なクロマチン状態に近いが,in vivo移植のみがそれらの正しい同一性に向けて細胞を指示する。まとめると,著者らの多染色体解析は,クロマチンと転写景観の両方が島細胞同一性において重要な役割を果たし,これらのデータはSC-膵島細胞のクロマチンと転写状態における特異的欠損を同定するための資源として使用できることを示した。【JST・京大機械翻訳】

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代謝異常・栄養性疾患一般 , 代謝異常・栄養性疾患の治療

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