生細胞におけるADAR編集を用いたモジュールおよびプログラマブルRNAセンシング【JST・京大機械翻訳】

Kaseniit, K. E.; Katz, N.; Kolber, N. S.; Call, C. C.; Wengier, D. L.; Cody, W. B.; Sattely, E. S.; Gao, X. J.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202210431426543 整理番号：22P0313719

生細胞におけるADAR編集を用いたモジュールおよびプログラマブルRNAセンシング【JST・京大機械翻訳】

Modular and programmable RNA sensing using ADAR editing in living cells

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発行年： 2022年01月29日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年01月29日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

単一細胞トランスクリプトームのアベイラビリティの増加により,RNAシグネチャは生細胞を標的化するための有望な基礎を提供する。分子RNAセンサは,特にヒト患者と非モデル生物において,多様な状況における特異的細胞型/statに対する研究および治療介入の研究を可能にする。ここでは,RNA(RADAR)に作用するアデノシンデアミナーゼを用いたライブRNAセンシングのためのモジュール型およびプログラム可能な設計について述べる。この基本設計を検証し,その性能を特性化し,ヒト/マウストランスクリプトームとの適合性を徹底的に解析した。また,出力レベルをさらに高め,ダイナミックレンジを改善する戦略を同定した。RADARはプログラマブルでモジュール型であり,コンパクトAND論理を可能にすることを示した。定量的に加えて,RADARは疾患関連点突然変異を識別することができる。最後に,RADARは多様な生物で機能する可能性を有する自己含有システムであることを示した。【JST・京大機械翻訳】

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遺伝子発現

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