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J-GLOBAL ID：202202210438521061   整理番号：22A0573884

Watson-Crick水素結合の選択的消滅によるDNA構造完全性の評価:分子動力学シミュレーションからの洞察【JST・京大機械翻訳】

Assessing the DNA structural integrity via selective annihilation of Watson-Crick hydrogen bonds: Insights from molecular dynamics simulations

著者 (2件)： Pant Pradeep (Department of Chemistry, Indian Institute of Technology Delhi, Hauz Khas, New Delhi 110016, India) ,  Aggarwal Leena (Department of Chemistry, University of Delhi, Delhi 110007, India)
資料名： Biophysical Chemistry  (Biophysical Chemistry)
巻： 282  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： E0824A  ISSN： 0301-4622  CODEN： BICIAZ  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 二重ヘリックスB-DNA型構造をもたらすポリヌクレオチド鎖により示される塩基対とスタッキングの役割を理解することは,DNAの洗練された構造配列へのアクセスを得るために重要である。いくつかの計算および実験研究は,二重安定性に対する積層に対する塩基対の支配にヒントを与えた。個々のWatson-Crick水素結合がDNAの二重ヘリックス完全性を維持する方法を見出すため,A-TとG-C塩基対の力場を操作することにより,水素結合(全ての塩基対で1つの特異的結合またはそれらの組み合わせ)を選択的にスイッチした。全原子陽溶媒分子動力学シミュレーション(それぞれ200ns)を通して12のシステムを研究した。MD出力構造を,モデルシステムのB-DNA特性に及ぼすH-結合(s)の除去の全体的結果をモニターするために,構造,動的およびエネルギー特性によって,制御システムと比較した。著者らの知見は,塩基対形成に関与するすべての個々の水素結合が,Watson-Crick水素結合(s)における可能な変化がDNA鎖の崩壊/崩壊をもたらし,変性状態をもたらすDNA構造完全性を維持するのに重要であることを示唆する。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 安定性 ,  *水素結合 ,  *計算機シミュレーション ,  制御系 ,  *DNA【核酸】 ,  ポリヌクレオチド ,  塩基対 ,  二重螺旋 ,  完全性 ,  力の場 ,  B-DNA
準シソーラス用語： 静電気学 ,  *分子動力学シミュレーション ,  塩基対形成 ,  *DNA構造 ,  エネルギー特性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： デオキシリボ核酸(DNA) ,  分子動力学シミュレーション ,  Watson-Crick水素結合 ,  変性 ,  静電気学

分類 (1件)： 核酸一般  (EB04010U)

タイトルに関連する用語 (6件)： 水素結合 ,  DNA構造 ,  完全性 ,  評価 ,  分子動力学シミュレーション ,  洞察