フランス,Omicron変異体循環中のSARS-CoV-2同時感染の検出および有病率  2021年2月2022日【JST・京大機械翻訳】

Bal, A.; Simon, B.; Destras, G.; Chalvignac, R.; Semanas, Q.; Oblette, A.; Queromes, G.; Fanget, R.; Regue, H.; Morfin, F.; Valette, M.; Lina, B.; Josset, L.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202210471747849 整理番号：22P0321911

フランス,Omicron変異体循環中のSARS-CoV-2同時感染の検出および有病率 2021年2月2022日【JST・京大機械翻訳】

Detection and prevalence of SARS-CoV-2 co-infections during the Omicron variant circulation, France, December 2021 - February 2022

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資料名：
発行年： 2022年03月27日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月27日
JST資料番号： O7002B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

Dec2021-Feb2022において,高い遺伝的多様性を有するSARS-CoV-2変異体の強烈で前例のない共循環は,変異体とそれらを検出する方法の間の可能な共感染の問題を提起した。異なる比率でのDelta:Omicron分離株の11混合物を用いて,全ゲノム配列決定に用いたプライマーの4つの異なるセットの性能を評価し,関与するSARS-CoV-2系統に関係なく,全ての共感染を検出できる不偏バイオインフォマティクス法を開発した。フランスのランダムゲノム監視から49~2021週と08~2022年の間に採取した21,387試料に適用し,異なる系統間の53の共感染を検出した。DeltaおよびOmicron(BA.1)共感染およびOmicron系統BA.1およびBA.2共感染の有病率は,それぞれ,0.18%および0.26%と推定された。6,242人の入院患者の間で,集中治療室(ICU)入院率は,それぞれ,Omicron,DeltaおよびDelta/Omicron患者において,1.64%,4.81%および15.38%であった。ICU入院患者の間で,BA.1/BA.2共感染は報告されなかった。SARS-CoV-2共感染は稀であったが,それらの適切な検出は,それらの臨床的影響と潜在的組換え体の出現のリスクを評価するために重要である。【JST・京大機械翻訳】

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ウイルスの生化学 , 遺伝子の構造と化学

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