潰瘍性大腸炎マウスモデルのトランスクリプトームプロファイリングはヒト大腸炎のバイオマーカーと治療標的を示唆する【JST・京大機械翻訳】

Yarani, R.; Palasca, O.; Doncheva, N. T.; Anthon, C.; Pilecki, B.; Svane, C. A. S.; Mirza, A. H.; Litman, T.; Holmskov, U.; Bang-Berthelsen, C. H.; Vilien, M.; Jensen, L. J.; Gorodkin, J.; Pociot, F.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202210686978760 整理番号：22P0244706

潰瘍性大腸炎マウスモデルのトランスクリプトームプロファイリングはヒト大腸炎のバイオマーカーと治療標的を示唆する【JST・京大機械翻訳】

Transcriptome profiling of ulcerative colitis mouse model suggests biomarkers and therapeutic targets for human colitis

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発行年： 2020年08月12日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年08月12日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

1.BACKGROUND&AIMSUlcerative大腸炎(UC)は病因不明の炎症性腸疾患である。その複雑な性質を考えると,その病態生理を研究するためのin vivo研究は極めて重要である。動物モデルは,ヒト疾患に寄与する機構を特定するのに必要な分子プロファイリングにおいて重要な役割を果たす。したがって,ヒトUCとマウスモデルの間の共通保存遺伝子発現シグネチャと特異的調節経路を同定し,健康な個人からUC患者を同定し,新規治療ターゲットとバイオマーカー候補を示唆することを目的とした。【方法】著者らは,最も広く使用されたUCマウスモデル,デキストラン硫酸ナトリウム(DSS)モデルのトランスクリプトーム景観を包括的に特徴づけるために,ハイスループット全および小RNA配列決定を行った。遺伝子発現プロファイルと経路を比較するために,公的に利用可能なヒトUCトランスクリプトームデータと併せてこのデータを使用した。【結果】UCマウスの結腸および血液から,差次的に制御された蛋白質コード遺伝子,長い非コードRNAおよびマイクロRNAを同定し,さらに,これらの遺伝子が疾患発生および進行に寄与する可能性がある経路および生物学的過程を特性化した。ヒトおよびマウスUCデータセットを統合することにより,著者らは,UC結腸および血液における51の差別的に制御された遺伝子のセットを示唆し,分子表現型分類を改善し,治療決定,薬物発見および臨床試験の設計を助ける可能性がある。【結論】DSS-UCマウスモデルのグローバルトランスクリプトーム解析は,遺伝子発現と疾患表現型の関係を同定することを通して,ヒトUCにおける治療および診断応用のための新しい標的を発見するための効率的なハイスループットツールとしての使用を支持する。【JST・京大機械翻訳】

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消化器の基礎医学

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