単一分子RNA修飾プロファイリングにより明らかにされたリボソームの機能中心におけるヌクレオチドの協調修飾【JST・京大機械翻訳】

Bailey, A. D.; Talkish, J.; Ding, H.; Igel, H.; Duran, A.; Mantripragada, S.; Paten, B.; Ares, M.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202210959662966 整理番号：22P0030174

単一分子RNA修飾プロファイリングにより明らかにされたリボソームの機能中心におけるヌクレオチドの協調修飾【JST・京大機械翻訳】

Concerted modification of nucleotides at functional centers of the ribosome revealed by single-molecule RNA modification profiling

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発行年： 2022年03月25日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月25日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

RNAとDNAのヌクレオチドは,それらの機能を変化させる多数の酵素によって化学的に修飾される。真核生物リボソームRNA(rRNA)は,特に高度に保存され機能的に重要なヌクレオチドで100以上の部位で修飾されている。リボソーム生合成の間,修飾は集合の種々の段階で追加される。単一rRNA分子内の全ての部位で修飾状態を同時に評価する方法が存在しないため,正常細胞におけるリボソームの異なる修飾クラスの存在は知られていない。酵母遺伝学とナノポア直接RNA配列決定の組み合わせを用いて,18S rRNAの37部位と25S rRNAの73部位での単一rRNA分子の修飾状態を追跡する信頼できる方法を開発した。この方法を用いて,修飾不均一性のパターンを特性化し,リボソームの機能性中心近くのヌクレオチドの協奏的修飾を同定した。rRNAの修飾亜集団はDbp3またはPrp43 RNAヘリカーゼの喪失により蓄積し,リボソーム生合成における重複役割を示唆した。修飾プロファイルは,翻訳,リボソーム生合成およびプレmRNAスプライシングに影響する多くの遺伝的および急性環境条件に対する応答の変化に対して驚くほど耐性である。単一分子RNA修飾プロファイルを捕捉する能力は,RNA機能におけるヌクレオチド修飾の役割に新しい洞察を提供する。RNA修飾の単一分子プロファイリングを可能にする高光O_LI法が開発され,修飾リボソームの不均一クラスを明らかにした。C_LIO_LIrRNA 2Oメチル化とプソイドリジル化修飾は互いに独立である。リボソームのC_LIO_LIin機能中心は協奏的に修飾される。RNAヘリカーゼDbp3とPrp43に対するC_LIO_LIof機能は不完全修飾リボソームの離散重複亜集団を産生する。C_LIO_LI修飾プロファイルは,急速に変化する栄養条件および翻訳C_LIの摂動に弾力性がある。【JST・京大機械翻訳】

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遺伝子発現 , 分子遺伝学一般

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