ペプチド輸送体のプロトンカップリングとマルチスケール速度論機構【JST・京大機械翻訳】

Li, C.; Yue, Z.; Newstead, S.; Voth, G. A.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202211077147182 整理番号：21P0266202

ペプチド輸送体のプロトンカップリングとマルチスケール速度論機構【JST・京大機械翻訳】

Proton Coupling and the Multiscale Kinetic Mechanism of a Peptide Transporter

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発行年： 2022年05月16日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年05月16日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

プロトン共役ペプチド輸送体(POTs)は,原核生物および真核細胞における薬物およびプロドラッグ分子と同様に,ジおよびトリペプチドの取り込みに重要である。マルチスケールモデリングから,膜貫通プロトンフラックスがPOT蛋白質内で共役し,完全な機能サイクルの必須段階を駆動することを示した。1)膜貫通ヘリックス(TM)7上のグルタミン酸のプロトン化は細胞外ゲートを開き,リガンド侵入を可能にした。2)内部プロトン流はTM10上の第二保存グルタミン酸のプロトン化状態を変えることによってリガンドのサイトゾル放出を誘導する;3)TM7とTM10間のプロトン移動は,リガンドの関与なしに水プロトンシャットリングを介して熱力学的に駆動され,動力学的に許容される。今回の結果は,POTsの交互アクセスモデルに対する直接計算確認を与え,機能蛋白質機構の定量的マルチスケール動力学像を指摘した。【JST・京大機械翻訳】

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細胞膜の輸送

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